16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3417 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3417  putative FemAB family protein  100 
 
 		 328 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.658974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3683  FemAB family protein  96.65 
 
 		 328 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.830414  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0922  hypothetical protein  38.54 
 
 		 307 aa  152  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  35.88 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1791  hypothetical protein  32.55 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  22.14 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5355  hypothetical protein  27.78 
 
 		 359 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0746954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4293  hypothetical protein  25.34 
 
 		 334 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0525491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  27.27 
 
 		 354 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3925  hypothetical protein  25.34 
 
 		 334 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.0555776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5045  hypothetical protein  28.35 
 
 		 332 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.280998  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  25.65 
 
 		 363 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4584  hypothetical protein  28.35 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.91512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  25.3 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  22.79 
 
 		 360 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4359  hypothetical protein  28.27 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>