More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3349 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  234  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  44.26 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0453  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  40 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0285  XRE family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.17528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  41.67 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  42.11 
 
 		 216 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2410  transcriptional regulator, XRE family  35.45 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000774173  normal  0.481646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4196  transcriptional regulator, XRE family  32.98 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  39.13 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 490 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6209  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.280043  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3025  XRE family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 188 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314698  normal  0.932142 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  35.42 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  39.06 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  31 
 
 		 199 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  34.48 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 209 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 212 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  42.11 
 
 		 209 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4832  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12303  hypothetical protein  36.21 
 
 		 491 aa  47.8  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 175 aa  47.4  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3125  Cro/CI family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 180 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.11 
 
 		 481 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 252 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2732  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 180 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  40.35 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 194 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3025  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  37.88 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3072  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal  0.0716873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1273  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.4589 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0023  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.181624 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  40.91 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  41.38 
 
 		 421 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  41.38 
 
 		 421 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 256 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  29 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1328  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000725972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 478 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2295  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.302272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2591  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  31.31 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  40.98 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 500 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  33.33 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  40.98 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  31.31 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 505 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  40.98 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06770  predicted transcriptional regulator  41.82 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3225  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  40.98 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  49.02 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  31.31 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 496 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 474 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2456  XRE family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.20041 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35190  DNA-binding protein  42 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  40.98 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  40.98 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 516 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0766  helix-turn-helix domain protein  36.92 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  34.48 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  42.11 
 
 		 489 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  43.86 
 
 		 209 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 224 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 432 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>