145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3316 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  100 
 
 
416 aa  852  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  99.52 
 
 
416 aa  847  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  55.24 
 
 
445 aa  439  1e-122  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  55.48 
 
 
445 aa  439  1e-122  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  41.79 
 
 
431 aa  313  3e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  6.49364e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  41.79 
 
 
444 aa  313  4e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  41.39 
 
 
416 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  39.53 
 
 
401 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  37.08 
 
 
432 aa  287  3e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  37.91 
 
 
434 aa  285  1e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  39.32 
 
 
434 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  6.79414e-05 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  39.45 
 
 
434 aa  279  8e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1632  HK97 family phage portal protein  37.5 
 
 
429 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543468  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  37.53 
 
 
407 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  39.67 
 
 
434 aa  233  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  37.22 
 
 
445 aa  226  5e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  6.93474e-09 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  34.95 
 
 
414 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  34.95 
 
 
414 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  32.2 
 
 
413 aa  201  1e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.75865e-11 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  32.2 
 
 
413 aa  201  2e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36411e-08 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  31.92 
 
 
413 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  35.03 
 
 
440 aa  199  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  32.99 
 
 
444 aa  197  4e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  32.93 
 
 
420 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  32.62 
 
 
411 aa  186  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  31.5 
 
 
425 aa  183  4e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  31.5 
 
 
425 aa  183  4e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  31.5 
 
 
425 aa  183  4e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  30.95 
 
 
421 aa  181  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  29.9 
 
 
417 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  35.91 
 
 
411 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  33.16 
 
 
409 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  30.33 
 
 
408 aa  172  8e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  31.65 
 
 
412 aa  165  1e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  30.99 
 
 
424 aa  164  4e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  30.81 
 
 
384 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  31.62 
 
 
524 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  31.46 
 
 
423 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  28.57 
 
 
390 aa  153  4e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  28.88 
 
 
419 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  31.34 
 
 
428 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  30.23 
 
 
473 aa  141  2e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  27.19 
 
 
389 aa  140  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  5.55494e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  30.29 
 
 
426 aa  137  3e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  27.27 
 
 
404 aa  134  4e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  26.67 
 
 
417 aa  132  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  28.45 
 
 
404 aa  129  9e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  28.2 
 
 
544 aa  128  2e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2472  phage portal protein, HK97 family  27.11 
 
 
542 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  27.53 
 
 
407 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  26.12 
 
 
395 aa  122  1e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  28.03 
 
 
420 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  26.19 
 
 
408 aa  118  2e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  26.46 
 
 
428 aa  115  1e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5506  phage portal protein, HK97 family  26.69 
 
 
408 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.709326  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1045  head portal protein  25.72 
 
 
460 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.326172  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  27.05 
 
 
412 aa  112  1e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  23.37 
 
 
436 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  26.75 
 
 
398 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  27.27 
 
 
454 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  27.27 
 
 
454 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  24.08 
 
 
436 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  24.08 
 
 
436 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  26.58 
 
 
408 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  25.14 
 
 
414 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  24.33 
 
 
415 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2199  HK97 family portal protein , putative  33.17 
 
 
225 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  25.84 
 
 
413 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  24.46 
 
 
409 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  26.3 
 
 
455 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3865  HK97 family phage portal protein  25.14 
 
 
429 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00272242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  27.6 
 
 
416 aa  104  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  24.68 
 
 
455 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  25.48 
 
 
859 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.40812e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  25.48 
 
 
833 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  25.48 
 
 
833 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  6.39413e-05 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  24.33 
 
 
441 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  24.42 
 
 
457 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  24.11 
 
 
447 aa  99.8  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2502  phage portal protein, HK97 family  24.44 
 
 
420 aa  98.6  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160981  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2997  putative head portal protein  26.12 
 
 
408 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  24.87 
 
 
397 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  25.12 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  25.32 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  25.47 
 
 
413 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0903  HK97 family phage portal protein  28.8 
 
 
391 aa  94  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.580107 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  26.46 
 
 
392 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  24 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  23.82 
 
 
407 aa  90.1  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1303  phage portal protein, HK97 family  25 
 
 
437 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  27.73 
 
 
397 aa  90.1  7e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2688  phage portal protein, HK97 family  26.14 
 
 
464 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.912505  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  25 
 
 
451 aa  87  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  25.28 
 
 
391 aa  85.9  1e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  22.63 
 
 
417 aa  82.4  1e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  25.43 
 
 
391 aa  81.6  2e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  23.91 
 
 
448 aa  82  2e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  21.98 
 
 
433 aa  82  2e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.6128e-12 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3805  hypothetical protein  21.99 
 
 
404 aa  80.5  5e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4093  hypothetical protein  22.22 
 
 
389 aa  80.1  6e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>