More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3282 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  100 
 
 
315 aa  621  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  99.68 
 
 
315 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  91.11 
 
 
314 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  63.33 
 
 
300 aa  323  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  61.09 
 
 
302 aa  318  6e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  59 
 
 
312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  61.51 
 
 
310 aa  281  7.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  47.95 
 
 
319 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  37.53 
 
 
389 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  45.85 
 
 
324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  42.38 
 
 
373 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  43.05 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  45.42 
 
 
296 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  47.73 
 
 
289 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  40.49 
 
 
377 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  41.48 
 
 
382 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  41.48 
 
 
382 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  36.09 
 
 
357 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  43.48 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  42.35 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  39.93 
 
 
381 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  39.75 
 
 
384 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  39.56 
 
 
375 aa  179  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  37.82 
 
 
344 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  40.15 
 
 
376 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  43.93 
 
 
304 aa  175  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  39.18 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  39.26 
 
 
386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  38.24 
 
 
374 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  41.6 
 
 
291 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  38.11 
 
 
391 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  38.71 
 
 
291 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  38.71 
 
 
291 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  38.71 
 
 
291 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  38.71 
 
 
291 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  38.55 
 
 
291 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  38.55 
 
 
291 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  40.85 
 
 
293 aa  169  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  38.55 
 
 
291 aa  169  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  42.31 
 
 
291 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  37.89 
 
 
353 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  37.82 
 
 
291 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  41.88 
 
 
291 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  42.57 
 
 
314 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.88 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.67 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  37.01 
 
 
373 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.21 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  38.46 
 
 
292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 
292 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  37.67 
 
 
377 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  37.62 
 
 
383 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  35.54 
 
 
374 aa  159  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  35.54 
 
 
342 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  41.18 
 
 
322 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.65 
 
 
299 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  37.72 
 
 
291 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  38.63 
 
 
435 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  34.38 
 
 
292 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  38.46 
 
 
291 aa  149  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  37.82 
 
 
311 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2289  Mg2+/Co2+ transporter  37.6 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  33.96 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  32.25 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  34.53 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  34.53 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  33.98 
 
 
292 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  43.11 
 
 
313 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  32.61 
 
 
284 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  35.42 
 
 
298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  32.22 
 
 
296 aa  145  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  35.53 
 
 
293 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  35.06 
 
 
295 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.89 
 
 
295 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  37.1 
 
 
295 aa  143  4e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  34.33 
 
 
295 aa  143  5e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  33.8 
 
 
309 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  34.32 
 
 
295 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  33.8 
 
 
309 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  33.69 
 
 
281 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.56 
 
 
295 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.56 
 
 
295 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.56 
 
 
295 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.56 
 
 
295 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.56 
 
 
295 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.56 
 
 
295 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3530  CBS:transporter-associated region  36.02 
 
 
282 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0231073 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.56 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  33.69 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  46.94 
 
 
420 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  39.27 
 
 
439 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  33.6 
 
 
291 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  33.09 
 
 
279 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  33.95 
 
 
295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  34.93 
 
 
284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  33.95 
 
 
295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  33.95 
 
 
295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  36.93 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1951  magnesium and cobalt efflux protein  36.93 
 
 
323 aa  139  6e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>