More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3276 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  100 
 
 		 211 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  99.51 
 
 		 206 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  91.94 
 
 		 211 aa  347  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  74.74 
 
 		 194 aa  260  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  69.15 
 
 		 203 aa  251  7e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  63.92 
 
 		 212 aa  234  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  55.67 
 
 		 216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  53.69 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  52.86 
 
 		 219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  53.33 
 
 		 219 aa  194  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  52.71 
 
 		 212 aa  194  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  51.9 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  51.43 
 
 		 214 aa  192  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  50.49 
 
 		 212 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  53.2 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  51.94 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  52.22 
 
 		 217 aa  187  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0715  cytidylate kinase  64.52 
 
 		 204 aa  187  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  54.15 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  53.2 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  54.59 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  51.23 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  54.37 
 
 		 208 aa  181  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  50 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  57.07 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  52.4 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  56.31 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  49.29 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  46.31 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  49.26 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  53.4 
 
 		 213 aa  174  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  55.12 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  50.23 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  51.2 
 
 		 212 aa  168  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  54.5 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  54.5 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  51.6 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  49.29 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  46.3 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  39.53 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1392  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.55 
 
 		 673 aa  155  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  43.52 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2468  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.09 
 
 		 673 aa  155  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.835531  normal  0.361895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  41.44 
 
 		 227 aa  153  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  45.41 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  38.64 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  53.97 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1567  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  41.47 
 
 		 669 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.484392  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2916  cytidylate kinase  50 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0479896 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  43.63 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  41.94 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3014  cytidylate kinase  39.17 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000196489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  40.85 
 
 		 225 aa  148  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  41.31 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  43.56 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  40.72 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  40.72 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  37.55 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  46.19 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  41.86 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  41.83 
 
 		 232 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  38.05 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  38.89 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3123  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  45.15 
 
 		 705 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.921195  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  40.44 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0254  cytidylate kinase  37.27 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.13077  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  39.25 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  40.18 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  40.83 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  37.33 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 228 aa  141  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  40.44 
 
 		 229 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  43.11 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  43.4 
 
 		 228 aa  141  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>