72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3264 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 104 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  98.08 
 
 		 104 aa  199  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  57.61 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  52.87 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  52.75 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  64.2 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  56.18 
 
 		 97 aa  96.7  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  51.69 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  51.06 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  48.98 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  48.96 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  52.33 
 
 		 178 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  48.96 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  48.96 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  65.52 
 
 		 119 aa  84.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  47.73 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4012  gas vesicle protein GVPa  61.02 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  59.62 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  45.45 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.89 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  48.44 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  40.54 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4008  gas vesicle synthesis-like protein  50.94 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  35.63 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  45.1 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  45.1 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  56.6 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6855  hypothetical protein  46.77 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  61.9 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0326  gas vesicle synthesis protein GvpA  57.14 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  51.11 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  41.27 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  51.11 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  51.11 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0328  gas vesicle synthesis protein GvpA  57.14 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.518273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0327  gas vesicle synthesis protein GvpA  57.14 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.516569 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  38.71 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  55.56 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  46.77 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  50.98 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  53.33 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0062  gas vesicle synthesis protein GvpA  59.52 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  38.46 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0063  gas vesicle synthesis protein GvpA  59.52 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0061  gas vesicle synthesis protein GvpA  59.52 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0060  gas vesicle synthesis protein GvpA  59.52 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.537884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  51.11 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  42.59 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  37.7 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  42 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  39.71 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  42.31 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  42.31 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  42 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1006  gas vesicle synthesis-like protein  47.17 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  42.31 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  42.31 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3382  gas vesicle protein GVPa  58.97 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0355765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  42.31 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  42.31 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2356  gas vesicle protein GVPa  43.42 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0939575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0339  hypothetical protein  35.09 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.881514  normal  0.486472 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  42.31 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1803  gas vesicle protein GVPa  42.59 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  52.27 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  46.15 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  46.15 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1260  gas vesicle protein GVPa  40.48 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128453  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2349  gas vesicle protein GVPa  34.88 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3022  gas vesicle protein GVPa  33.33 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  37.29 
 
 		 230 aa  41.2  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4700  gas vesicle protein GVPa  45.45 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>