More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3238 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3321  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  50.18 
 
 
781 aa  753    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.98232  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1904  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  52.28 
 
 
787 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2551  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  47.25 
 
 
784 aa  643    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4621  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  52.38 
 
 
777 aa  786    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2096  xanthine dehydrogenase subunit B  49.39 
 
 
792 aa  704    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4865  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  45.43 
 
 
796 aa  678    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0350  xanthine dehydrogenase, putative  52.14 
 
 
780 aa  763    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3661  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  48 
 
 
792 aa  731    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2041  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  52.28 
 
 
787 aa  691    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1814  xanthine dehydrogenase  48.24 
 
 
839 aa  738    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838049  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2301  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  49.03 
 
 
797 aa  733    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.794851  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3760  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  50.55 
 
 
764 aa  704    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3213  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  52.4 
 
 
787 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3555  xanthine oxidase  99.15 
 
 
825 aa  1646    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4498  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  52.98 
 
 
785 aa  792    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.736766  normal  0.0805913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3925  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  49.69 
 
 
784 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3159  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.4 
 
 
787 aa  693    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0225  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.55 
 
 
793 aa  756    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467704  normal  0.0688088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0452  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  51.28 
 
 
784 aa  758    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1409  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  52.52 
 
 
787 aa  702    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.836704  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0712  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.76 
 
 
818 aa  751    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685253  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2752  xanthine oxidase  46.66 
 
 
798 aa  696    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.988781  normal  0.624971 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0936  xanthine oxidase  64.77 
 
 
812 aa  1033    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192035  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2862  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.92 
 
 
779 aa  790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303628  normal  0.42301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2698  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  44.9 
 
 
779 aa  662    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1154  xanthine dehydrogenase  50.72 
 
 
812 aa  738    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547676  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1480  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  51.53 
 
 
801 aa  747    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0949  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  50.49 
 
 
802 aa  750    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3810  xanthine dehydrogenase  47.33 
 
 
799 aa  703    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3198  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.4 
 
 
787 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3461  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.09 
 
 
787 aa  702    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222432 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1788  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  49.27 
 
 
797 aa  687    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0892  xanthine oxidase  45.89 
 
 
783 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0579725  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2959  xanthine dehydrogenase molybdenum-binding subunit  68.73 
 
 
781 aa  1098    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0461211 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0498  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  64.33 
 
 
782 aa  1026    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3042  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.21 
 
 
800 aa  756    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.0190661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2705  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  52.13 
 
 
777 aa  795    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.233827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1589  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  46.54 
 
 
799 aa  699    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.589614  normal  0.979072 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2425  xanthine dehydrogenase  45.43 
 
 
784 aa  679    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2834  xanthine oxidase  55.54 
 
 
781 aa  847    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.266912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0712  xanthine dehydrogenase  50.31 
 
 
787 aa  719    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3906  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  48.14 
 
 
816 aa  705    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3238  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  100 
 
 
825 aa  1662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338159  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44740  xanthine dehydrogenase  47.82 
 
 
799 aa  707    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0454132 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0859  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.3 
 
 
794 aa  779    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3135  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.95 
 
 
779 aa  757    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.787826  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2421  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.82 
 
 
785 aa  730    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3947  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  92.74 
 
 
825 aa  1487    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0952887 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4258  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  52.13 
 
 
770 aa  788    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.933602  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1789  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  45.65 
 
 
767 aa  636    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.65016  normal  0.238087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0729  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.18 
 
 
787 aa  716    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0872  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  52.28 
 
 
787 aa  691    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.208444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2706  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  52.28 
 
 
787 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.970809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1454  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  45.52 
 
 
772 aa  630  1e-179  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1141  xanthine dehydrogenase  42.94 
 
 
856 aa  622  1e-177  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.864044  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02516  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  43.29 
 
 
788 aa  621  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.973765  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1637  xanthine oxidase  42.98 
 
 
767 aa  549  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3719  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  61.27 
 
 
779 aa  455  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22280  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  59.2 
 
 
797 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.775322  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3843  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.56 
 
 
799 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303444  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4279  xanthine dehydrogenase, XdhB subunit  57.29 
 
 
799 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229569  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1796  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  56.76 
 
 
797 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246006  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3605  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.5 
 
 
799 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.82083  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3885  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  57.91 
 
 
788 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5001  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  59.21 
 
 
828 aa  428  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5909  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.1 
 
 
808 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0794  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.91 
 
 
788 aa  425  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0805  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.33 
 
 
787 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2247  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.18 
 
 
788 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0833  hypothetical protein  57.6 
 
 
787 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551522  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1923  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.45 
 
 
788 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2426  xanthine oxidase  55.85 
 
 
793 aa  415  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511949  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0349  xanthine dehydrogenase  57.33 
 
 
787 aa  416  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3103  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  56.05 
 
 
801 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2449  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.46 
 
 
801 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1338  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.75 
 
 
814 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.01144  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0798  xanthine oxidase  57.41 
 
 
830 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1129  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  55.47 
 
 
823 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.818016  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1034  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  56.6 
 
 
799 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0974442  normal  0.558383 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2604  xanthine dehydrogenase  50.89 
 
 
800 aa  353  8.999999999999999e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0258  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.65 
 
 
804 aa  345  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1730  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  26.77 
 
 
754 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.142729  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  44.76 
 
 
1350 aa  276  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6766  Xanthine dehydrogenase  40.62 
 
 
769 aa  275  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  43.7 
 
 
1363 aa  270  7e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  41.58 
 
 
1387 aa  266  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0838  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  29.62 
 
 
781 aa  211  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0432  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  34.01 
 
 
753 aa  195  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1135  hypothetical protein  24.79 
 
 
713 aa  192  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2835  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, alpha subunit  26.95 
 
 
797 aa  189  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1642  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  27 
 
 
782 aa  189  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0934  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  32.12 
 
 
542 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00530941  normal  0.265769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20100  aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, large subunit CoxL/CutL-like protein  27.45 
 
 
751 aa  181  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0809165  hitchhiker  0.000713838 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2877  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  25.5 
 
 
790 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.956193  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1523  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  25.5 
 
 
790 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.148694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3387  xanthine dehydrogenase D subunit  26.88 
 
 
761 aa  173  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2659  carbon monoxide dehydrogenase large chain  25.4 
 
 
791 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1143  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  24.94 
 
 
790 aa  171  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0232899  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1765  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  26.06 
 
 
788 aa  170  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.234774 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0076  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  26.52 
 
 
801 aa  170  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.353097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>