More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3136 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3136  protein phosphatase 2C domain-containing protein  100 
 
 
251 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  96.81 
 
 
248 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  54.23 
 
 
258 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  45.29 
 
 
256 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  41.11 
 
 
267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  43.23 
 
 
264 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  43.59 
 
 
463 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  43.95 
 
 
256 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.73 
 
 
243 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  45.93 
 
 
239 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  46.96 
 
 
348 aa  156  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  42.48 
 
 
242 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.91 
 
 
237 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  41.03 
 
 
264 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  40.97 
 
 
236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  44.78 
 
 
259 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  44.21 
 
 
234 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  42.54 
 
 
463 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  39.04 
 
 
323 aa  153  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  37.99 
 
 
255 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  42.04 
 
 
242 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  43.05 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.85 
 
 
242 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  42.36 
 
 
320 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  43.51 
 
 
256 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  41.74 
 
 
505 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  43.48 
 
 
234 aa  149  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  40.49 
 
 
242 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  42.42 
 
 
247 aa  149  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  41.36 
 
 
452 aa  148  8e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  41.99 
 
 
319 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  39.55 
 
 
395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  40.08 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  37.97 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  38.15 
 
 
313 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  39.24 
 
 
242 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  41.13 
 
 
394 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  42.92 
 
 
421 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1520  putative phosphoprotein phosphatase  37.12 
 
 
241 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.101947 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  43.48 
 
 
381 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  38.17 
 
 
325 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  39.22 
 
 
256 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  39.65 
 
 
449 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  42.98 
 
 
293 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  35.06 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  35.17 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  37.07 
 
 
478 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  40.91 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  38.1 
 
 
574 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  35.34 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  30.93 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  40.17 
 
 
441 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  39.82 
 
 
425 aa  140  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  41.56 
 
 
472 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  39.68 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  35.96 
 
 
548 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  35.06 
 
 
243 aa  138  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  38.4 
 
 
252 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.25 
 
 
241 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  41.56 
 
 
519 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
241 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  38.71 
 
 
567 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.64 
 
 
482 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  39.3 
 
 
242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  39.29 
 
 
256 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  39.29 
 
 
256 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  42.79 
 
 
422 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  34.48 
 
 
236 aa  135  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  37.07 
 
 
597 aa  135  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  39.65 
 
 
554 aa  134  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  37.4 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.41 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  39.84 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  46.55 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  38.7 
 
 
571 aa  133  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  37.23 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  36.6 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.22 
 
 
438 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  32.91 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0192  protein serine/threonine phosphatase  37.55 
 
 
268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.4 
 
 
611 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.42 
 
 
280 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  33.87 
 
 
254 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  36.95 
 
 
417 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  41.92 
 
 
469 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  45.85 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  42.27 
 
 
416 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  41.63 
 
 
267 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  39.83 
 
 
477 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  33.05 
 
 
250 aa  132  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  38.6 
 
 
426 aa  132  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  38.77 
 
 
466 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.8 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  41.23 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  35.52 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  40.87 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  38.86 
 
 
558 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  38.86 
 
 
540 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  38.58 
 
 
305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  38.36 
 
 
519 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>