More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3130 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  98.01 
 
 		 453 aa  850    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 453 aa  868    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  60.35 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  34.17 
 
 		 443 aa  169  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  33.59 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  32.67 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  33.84 
 
 		 438 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  34.79 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  34.62 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  35.01 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  32.95 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  33.52 
 
 		 494 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  33.78 
 
 		 456 aa  154  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  32.89 
 
 		 453 aa  143  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  31.66 
 
 		 460 aa  143  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  27.54 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  29.89 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  32.67 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  29.6 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  29.16 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  29.82 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  29.39 
 
 		 431 aa  133  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  30.29 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  25.5 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  30.79 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  32.65 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  30.62 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  30.79 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  30.79 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  30.5 
 
 		 434 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  33.24 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  32.84 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  32.84 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  29.3 
 
 		 447 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  32.13 
 
 		 511 aa  126  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  32.84 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  29.19 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  31.06 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  28.9 
 
 		 458 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  30.05 
 
 		 406 aa  123  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  32.68 
 
 		 438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  31.91 
 
 		 421 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  31.91 
 
 		 421 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  31.91 
 
 		 421 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  31.91 
 
 		 421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  31.91 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  31.91 
 
 		 421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  31.91 
 
 		 421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  25.83 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  32.34 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  30.48 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  31.15 
 
 		 493 aa  110  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  31.96 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  31.11 
 
 		 487 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  30.33 
 
 		 291 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  29.95 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  29.9 
 
 		 289 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  30.59 
 
 		 291 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  29.28 
 
 		 278 aa  97.1  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  31.86 
 
 		 404 aa  94  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  31.86 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.78 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  26.6 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  31.47 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  38.39 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  31.96 
 
 		 257 aa  79.3  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  29.77 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  39.84 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  35.16 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  51.25 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  26.02 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.86 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  26.35 
 
 		 273 aa  76.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  39.17 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  43.12 
 
 		 209 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  28.12 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  37.96 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4998  OmpA/MotB  39.2 
 
 		 119 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  51.25 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.1 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  35.36 
 
 		 1987 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  43.12 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  27.49 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  43.12 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  26.82 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  39.83 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>