50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3112 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3112  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  679    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192331  normal  0.139244 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3467  hypothetical protein  97.65 
 
 		 340 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2334  hypothetical protein  41.94 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00524729  normal  0.0110062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0538  hypothetical protein  41.98 
 
 		 373 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0171  hypothetical protein  40.76 
 
 		 370 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01180  hypothetical protein  40.47 
 
 		 399 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2439  hypothetical protein  40.48 
 
 		 366 aa  208  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2128  hypothetical protein  31.51 
 
 		 438 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3869  hypothetical protein  29.64 
 
 		 438 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0106797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7055  hypothetical protein  32.24 
 
 		 356 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0582367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  28.53 
 
 		 335 aa  122  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2438  Protein of unknown function DUF2169  34.07 
 
 		 383 aa  122  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7560  hypothetical protein  32 
 
 		 348 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0291  hypothetical protein  29.08 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2759  hypothetical protein  31.94 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1192  hypothetical protein  28.03 
 
 		 447 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4073  hypothetical protein  32.93 
 
 		 373 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125532 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3484  hypothetical protein  31.56 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3387  hypothetical protein  27.7 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128743  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1160  hypothetical protein  31.08 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4428  hypothetical protein  27.03 
 
 		 445 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000445  pentapeptide repeat family protein  31.67 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05867  hypothetical protein  27.78 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2738  hypothetical protein  30.14 
 
 		 383 aa  89.4  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  32.68 
 
 		 825 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  32.68 
 
 		 825 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  32.68 
 
 		 825 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  32.68 
 
 		 825 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  32.68 
 
 		 825 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  32.68 
 
 		 862 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  32.68 
 
 		 825 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 		 949 aa  83.2  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2827  hypothetical protein  31.51 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6142  hypothetical protein  38.84 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  28.03 
 
 		 846 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  27.96 
 
 		 866 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  31.82 
 
 		 872 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  25.55 
 
 		 976 aa  70.1  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  26.94 
 
 		 886 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  31.55 
 
 		 844 aa  66.2  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  31.15 
 
 		 870 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3016  hypothetical protein  27.04 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  27.72 
 
 		 881 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0930  hypothetical protein  31.74 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0087813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 		 880 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 		 877 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 		 880 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 		 880 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 		 880 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  32.43 
 
 		 880 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>