More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3068 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3068  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3423  exodeoxyribonuclease III  97.64 
 
 		 255 aa  480  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  69.57 
 
 		 255 aa  377  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  69.8 
 
 		 260 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  69.53 
 
 		 259 aa  371  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  70.7 
 
 		 269 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3456  exodeoxyribonuclease III Xth  67.97 
 
 		 303 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  65.1 
 
 		 258 aa  362  4e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1491  exodeoxyribonuclease III Xth  66.67 
 
 		 264 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  66.02 
 
 		 261 aa  352  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.515839  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3010  exodeoxyribonuclease III Xth  65.62 
 
 		 265 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  65.62 
 
 		 264 aa  348  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2668  exodeoxyribonuclease III Xth  64.06 
 
 		 260 aa  348  6e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1386  exodeoxyribonuclease III Xth  64.31 
 
 		 263 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.031293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  63.28 
 
 		 265 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4910  exodeoxyribonuclease III  64.31 
 
 		 283 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.38033  decreased coverage  0.000445359 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5537  exodeoxyribonuclease III Xth  63.53 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3799  exodeoxyribonuclease III  66.01 
 
 		 256 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0877  exodeoxyribonuclease III Xth  64.03 
 
 		 264 aa  341  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09930  putative exonuclease III  64.31 
 
 		 266 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0994533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0921  exodeoxyribonuclease III  63.53 
 
 		 261 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2707  exodeoxyribonuclease III, putative  62.89 
 
 		 265 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1207  exodeoxyribonuclease III (xth)  66.01 
 
 		 256 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3728  exodeoxyribonuclease III Xth  67.45 
 
 		 256 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3424  exodeoxyribonuclease III  61.72 
 
 		 272 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.903718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5986  exodeoxyribonuclease III Xth  62.35 
 
 		 270 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2221  exodeoxyribonuclease III  61.96 
 
 		 270 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2122  exodeoxyribonuclease III  62.5 
 
 		 262 aa  330  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443475  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  63.53 
 
 		 259 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  63.49 
 
 		 260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0579  exodeoxyribonuclease III (xth)  61.9 
 
 		 274 aa  321  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2898  exodeoxyribonuclease III  64.57 
 
 		 284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  62.35 
 
 		 257 aa  318  7e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3911  exodeoxyribonuclease III  59.53 
 
 		 271 aa  316  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2180  exodeoxyribonuclease III (xth)  54.69 
 
 		 256 aa  288  6e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0156  exodeoxyribonuclease III  51.76 
 
 		 259 aa  275  7e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  52.12 
 
 		 266 aa  256  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  51.35 
 
 		 266 aa  256  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  50.77 
 
 		 261 aa  255  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  51.14 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  49.61 
 
 		 267 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  51.52 
 
 		 264 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  50.38 
 
 		 264 aa  249  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1784  exodeoxyribonuclease III  51.89 
 
 		 266 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144543  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2921  exodeoxyribonuclease III Xth  51.91 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  51.15 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  49.03 
 
 		 263 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  50.77 
 
 		 270 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  48.06 
 
 		 263 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  48.06 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  49.43 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  51.92 
 
 		 259 aa  241  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  48.09 
 
 		 263 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  51.54 
 
 		 259 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  48.66 
 
 		 261 aa  239  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  50.38 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  45.77 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  45.77 
 
 		 260 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  49.03 
 
 		 259 aa  235  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  47.49 
 
 		 262 aa  235  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  46.15 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  47.1 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  45.88 
 
 		 263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  49.41 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1683  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 258 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  45.77 
 
 		 263 aa  230  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  45.49 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  45.77 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0897  exodeoxyribonuclease III  45.15 
 
 		 268 aa  228  6e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  46.67 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  46.27 
 
 		 260 aa  225  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1920  exodeoxyribonuclease III  47.45 
 
 		 262 aa  221  9e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.19654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0660  exodeoxyribonuclease III  41.31 
 
 		 263 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969043  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0692  exodeoxyribonuclease III  41.31 
 
 		 263 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000190547  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3127  exodeoxyribonuclease III Xth  47.73 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  43.25 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  43.25 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  43.25 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  43.25 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  43.25 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  43.25 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  43.25 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  43.25 
 
 		 322 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  42.46 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0446  exodeoxyribonuclease III Xth  49.81 
 
 		 258 aa  203  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  44.71 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  41.67 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  46.51 
 
 		 264 aa  202  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  46.51 
 
 		 264 aa  202  6e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  42.46 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  41.25 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  42.06 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  42.06 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  43.36 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  41.9 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  41.27 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  41.27 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  41.34 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  42.69 
 
 		 258 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  41.76 
 
 		 269 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>