More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3062 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  57.81 
 
 		 797 aa  822    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  59.4 
 
 		 797 aa  813    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3330  hypothetical protein  81.12 
 
 		 714 aa  1168    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.641382  normal  0.572781 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3062  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 715 aa  1438    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.173013 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3417  TonB dependent outer membrane ferrichrome-iron receptor  98.6 
 
 		 715 aa  1420    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  57.71 
 
 		 797 aa  816    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  55.33 
 
 		 708 aa  798    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  46.53 
 
 		 699 aa  602  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.7 
 
 		 718 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  33.51 
 
 		 799 aa  293  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 778 aa  278  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  31.97 
 
 		 719 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  31.22 
 
 		 740 aa  273  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 829 aa  273  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  29.48 
 
 		 799 aa  270  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 733 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 821 aa  265  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  30.48 
 
 		 799 aa  265  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.5 
 
 		 833 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  31.06 
 
 		 817 aa  262  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  30.32 
 
 		 723 aa  263  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  29.86 
 
 		 745 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.57 
 
 		 806 aa  260  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 829 aa  260  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  27.96 
 
 		 701 aa  259  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000165675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  28.97 
 
 		 797 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 		 791 aa  258  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 		 706 aa  257  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  30.27 
 
 		 808 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 806 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3585  ferrichrome receptor precursor protein  30.16 
 
 		 718 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.885271  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 		 735 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  30.88 
 
 		 791 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  30.99 
 
 		 727 aa  252  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  29.66 
 
 		 724 aa  251  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 		 819 aa  250  6e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 717 aa  249  8e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  30.07 
 
 		 745 aa  249  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 		 724 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 794 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 		 757 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 		 696 aa  244  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  30.78 
 
 		 771 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 820 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 		 699 aa  243  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  31.13 
 
 		 699 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  28.43 
 
 		 747 aa  242  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 		 797 aa  242  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  29.62 
 
 		 801 aa  242  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  30.53 
 
 		 812 aa  242  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 		 863 aa  242  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 719 aa  242  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 828 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1139  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 		 736 aa  241  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  28.29 
 
 		 747 aa  241  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  29.9 
 
 		 769 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3731  putative ferrisiderophore receptor  31.63 
 
 		 728 aa  241  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 877 aa  240  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  30.4 
 
 		 789 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  28.29 
 
 		 747 aa  241  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 828 aa  240  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  28.37 
 
 		 745 aa  239  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  30.42 
 
 		 744 aa  239  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 771 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  28 
 
 		 747 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2580  iron(III) compound receptor  28.85 
 
 		 718 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000113666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 		 699 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  28.01 
 
 		 729 aa  238  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 810 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  28.01 
 
 		 703 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  28.01 
 
 		 703 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 828 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 744 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  29.12 
 
 		 729 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  27.88 
 
 		 726 aa  235  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 745 aa  235  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3474  ferrichrome receptor precursor protein  28.01 
 
 		 719 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  29.1 
 
 		 729 aa  234  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 714 aa  234  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  27.58 
 
 		 729 aa  234  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 705 aa  234  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  27.71 
 
 		 747 aa  234  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 779 aa  234  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 797 aa  233  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  27.29 
 
 		 747 aa  233  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 808 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  27.04 
 
 		 729 aa  232  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 721 aa  233  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 736 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  28.98 
 
 		 802 aa  232  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 736 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 752 aa  232  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 734 aa  232  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 741 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  28.57 
 
 		 753 aa  231  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  28.57 
 
 		 753 aa  231  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 701 aa  230  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 		 717 aa  230  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 754 aa  230  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 754 aa  230  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>