More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3039 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
264 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
264 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.14 
 
 
265 aa  364  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.82 
 
 
263 aa  274  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829399  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2708  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  40.87 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319241  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8304  ABC transporter  40.7 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0178234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1479  ABC transporter, permease protein  35.55 
 
 
260 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0195961  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.54 
 
 
265 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  0.52762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
264 aa  184  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334886  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
264 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.676109 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2522  ABC transporter, permease protein  37.75 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.75 
 
 
264 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
264 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 
264 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533361  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8169  ABC transporter membrane spanning protein  47.44 
 
 
260 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1834  ABC transporter, permease protein  38.82 
 
 
269 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
264 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381273  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0748  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  36.96 
 
 
264 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
264 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
264 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
264 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
264 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.332864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
264 aa  175  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
262 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2705  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  36.58 
 
 
265 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628706  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 
265 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
270 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00977235  normal  0.387076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.75 
 
 
264 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.303148  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
272 aa  164  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0758947  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360042  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2420  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  37.45 
 
 
281 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6091  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  38.16 
 
 
266 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417915  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3109  spermidine/putrescine ABC transporter permease  36.84 
 
 
282 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
282 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1221  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 
282 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
268 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
276 aa  159  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
269 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3243  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.33 
 
 
269 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
266 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.208097 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
262 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
265 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
262 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0037178  normal  0.4746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.911704  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
274 aa  155  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
550 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.957073  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
278 aa  155  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
596 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
268 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217099  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.86 
 
 
591 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621124  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2209  putrescine ABC transporter permease  40.97 
 
 
264 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.052298  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
275 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
277 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6500  ABC transporter permease  37.02 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0161656 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
265 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176391  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6247  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
266 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.487966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0750  ABC transporter permease  37.91 
 
 
276 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
259 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4679  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
287 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
270 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
266 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
272 aa  149  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395984  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42 
 
 
266 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.575148  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07900  putative permease of ABC transporter  37.44 
 
 
276 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280578 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2665  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  32.73 
 
 
271 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0357719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2399  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.58 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00651767  normal  0.388943 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
275 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2930  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  35.92 
 
 
279 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 
278 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
275 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.355956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1588  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  40.28 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.148375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
279 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471707  normal  0.190136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
275 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.29 
 
 
274 aa  145  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.026759  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4294  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
279 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144254  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.148364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.560014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.77 
 
 
275 aa  145  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.586316  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
276 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282406  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
279 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576146  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0812  polyamine ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 
279 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2359  putative polyamine ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 
289 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
272 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
268 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0474626  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2498  putative polyamine ABC transporter, permease protein  35.68 
 
 
289 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633965  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0645  polyamine ABC transporter, permease protein  34.66 
 
 
279 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637437  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
259 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.958438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
259 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
272 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
284 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>