More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3019 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
401 aa  787  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  787  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  92.02 
 
 
401 aa  723  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  57.71 
 
 
401 aa  454  1e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  1.78318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  56.47 
 
 
401 aa  447  1e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  54.46 
 
 
402 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  55.69 
 
 
400 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  53.73 
 
 
400 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  55.69 
 
 
400 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  53.98 
 
 
400 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  53.83 
 
 
402 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  53.83 
 
 
403 aa  408  1e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  49.77 
 
 
456 aa  407  1e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  53.45 
 
 
400 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  52.49 
 
 
402 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  52.49 
 
 
402 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  49.14 
 
 
403 aa  394  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  52.12 
 
 
403 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  51.99 
 
 
402 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  42.39 
 
 
406 aa  324  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  41.09 
 
 
406 aa  322  8e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  43.32 
 
 
409 aa  314  2e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  46.19 
 
 
409 aa  313  3e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  45.95 
 
 
409 aa  311  9e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  45.95 
 
 
409 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  43.73 
 
 
409 aa  302  5e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  41.08 
 
 
405 aa  303  5e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  43.56 
 
 
408 aa  295  7e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  43.98 
 
 
409 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  42.11 
 
 
443 aa  294  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  37.59 
 
 
406 aa  293  4e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  43.98 
 
 
409 aa  293  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57118e-10 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  42.4 
 
 
408 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  43.81 
 
 
409 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  42.08 
 
 
405 aa  289  5e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  39.36 
 
 
406 aa  288  1e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  4.72644e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  42.82 
 
 
409 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  40.25 
 
 
406 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  40.15 
 
 
658 aa  286  5e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  39.21 
 
 
715 aa  285  9e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  43.53 
 
 
402 aa  282  6e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  42.58 
 
 
411 aa  280  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  40.34 
 
 
656 aa  281  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  41.94 
 
 
404 aa  278  9e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  39.26 
 
 
412 aa  278  1e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  42.18 
 
 
671 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  40.25 
 
 
657 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  41.46 
 
 
409 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  38.61 
 
 
405 aa  273  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  41.03 
 
 
407 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  38.63 
 
 
657 aa  273  4e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  39.07 
 
 
405 aa  271  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  37.28 
 
 
649 aa  270  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  38.85 
 
 
391 aa  268  9e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  42.4 
 
 
409 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  43.14 
 
 
405 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  41.84 
 
 
707 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  38.57 
 
 
405 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  39.32 
 
 
653 aa  266  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  42 
 
 
412 aa  266  5e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  41.79 
 
 
657 aa  266  6e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  39.22 
 
 
411 aa  265  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  36.18 
 
 
454 aa  265  2e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  43.44 
 
 
410 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  37.78 
 
 
650 aa  264  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  37.19 
 
 
652 aa  263  5e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  40.15 
 
 
657 aa  261  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  39.85 
 
 
656 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  37.68 
 
 
409 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  39.61 
 
 
409 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  38.61 
 
 
405 aa  259  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  37.87 
 
 
405 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  37.87 
 
 
405 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  40.05 
 
 
654 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  36.41 
 
 
647 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  37.59 
 
 
644 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  37.22 
 
 
647 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  36.12 
 
 
678 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.12 
 
 
678 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.05037e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  36.12 
 
 
678 aa  256  6e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.85404e-05  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  39.85 
 
 
406 aa  255  9e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  42.5 
 
 
653 aa  254  2e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  38.6 
 
 
670 aa  253  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  37.84 
 
 
405 aa  253  4e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  37.84 
 
 
405 aa  253  4e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  37.62 
 
 
654 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  38.37 
 
 
661 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  36.66 
 
 
663 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  37.62 
 
 
403 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  37.35 
 
 
418 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  36.21 
 
 
663 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  39.66 
 
 
410 aa  245  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  36.88 
 
 
651 aa  245  1e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  37.38 
 
 
657 aa  244  2e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  40.29 
 
 
409 aa  244  2e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  36.34 
 
 
653 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  37.09 
 
 
681 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  37.09 
 
 
681 aa  242  8e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  43.22 
 
 
650 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  35.82 
 
 
696 aa  239  5e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  4.02561e-08  unclonable  1.13397e-09 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>