More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2906 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  98.43 
 
 
381 aa  760    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2906  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
381 aa  771    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789976  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  96.06 
 
 
381 aa  748    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_004310  BR0546  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  68.72 
 
 
390 aa  513  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3830  NAD binding oxidoreductase  65.8 
 
 
393 aa  508  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3410  oxidoreductase domain-containing protein  67.91 
 
 
390 aa  504  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2787  oxidoreductase domain-containing protein  66.75 
 
 
394 aa  491  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0450  oxidoreductase-like  64.91 
 
 
396 aa  481  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3703  oxidoreductase domain protein  64.75 
 
 
395 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604662  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3405  oxidoreductase domain protein  64.75 
 
 
395 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0548  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  67.73 
 
 
346 aa  483  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  69.52 
 
 
390 aa  467  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1860  oxidoreductase domain-containing protein  59.73 
 
 
394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0248551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  58.06 
 
 
378 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3671  putative oxidoreductase  57.91 
 
 
383 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205617  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0966  oxidoreductase domain protein  57.1 
 
 
384 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  56.01 
 
 
381 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4329  oxidoreductase domain-containing protein  53.83 
 
 
387 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2825  oxidoreductase domain-containing protein  53.85 
 
 
391 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4567  oxidoreductase domain-containing protein  51.34 
 
 
373 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4768  oxidoreductase domain-containing protein  55.95 
 
 
364 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.602784  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1734  oxidoreductase domain protein  49.6 
 
 
390 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  50.53 
 
 
377 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2827  oxidoreductase-like  52.65 
 
 
393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4863  oxidoreductase domain protein  51.19 
 
 
387 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0426  oxidoreductase domain-containing protein  51.06 
 
 
382 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3436  oxidoreductase domain protein  50.4 
 
 
378 aa  354  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.712943  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0392  oxidoreductase-like protein  50.4 
 
 
394 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0726261  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3267  oxidoreductase domain-containing protein  50 
 
 
385 aa  353  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4610  oxidoreductase domain-containing protein  48.94 
 
 
380 aa  351  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0495252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0452  oxidoreductase-like  51.88 
 
 
371 aa  346  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000137075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0362  oxidoreductase domain-containing protein  48.67 
 
 
396 aa  343  4e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1708  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  49.74 
 
 
391 aa  342  7e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3646  oxidoreductase domain protein  46.15 
 
 
385 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00430  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  47.72 
 
 
377 aa  335  9e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2690  oxidoreductase-like  46.86 
 
 
395 aa  332  5e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7280  oxidoreductase domain protein  47.51 
 
 
387 aa  332  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1779  oxidoreductase domain-containing protein  48.1 
 
 
389 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  46.32 
 
 
373 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3128  oxidoreductase-dehydrogenase  46.26 
 
 
376 aa  330  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2348  oxidoreductase domain protein  45.38 
 
 
399 aa  326  5e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.65588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0767  oxidoreductase-like protein  45.65 
 
 
396 aa  318  7e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2886  oxidoreductase domain-containing protein  46.3 
 
 
384 aa  316  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433924  hitchhiker  0.000000212172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0727  oxidoreductase domain-containing protein  40.53 
 
 
381 aa  306  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2765  oxidoreductase domain-containing protein  45.45 
 
 
393 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  38.61 
 
 
377 aa  275  9e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3345  oxidoreductase-like  37.43 
 
 
377 aa  263  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal  0.296481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4574  oxidoreductase-like  38.03 
 
 
390 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1248  hypothetical protein  39.22 
 
 
390 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1272  oxidoreductase domain protein  38.92 
 
 
377 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.796497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3019  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  37.67 
 
 
389 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.261421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50260  Oxidoreductase  37.67 
 
 
389 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1047  oxidoreductase domain protein  38.32 
 
 
388 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1634  oxidoreductase domain-containing protein  42.74 
 
 
378 aa  256  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.745172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0728  oxidoreductase domain-containing protein  34.4 
 
 
364 aa  256  5e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1983  oxidoreductase domain protein  41.67 
 
 
407 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093165  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1349  oxidoreductase domain-containing protein  37.23 
 
 
390 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1310  oxidoreductase domain-containing protein  36.97 
 
 
390 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0948  oxidoreductase-like  37.77 
 
 
390 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1408  oxidoreductase domain-containing protein  37.77 
 
 
390 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.67728 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1430  oxidoreductase domain-containing protein  37.77 
 
 
390 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0053  oxidoreductase domain-containing protein  37.3 
 
 
390 aa  248  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2924  oxidoreductase domain-containing protein  39.26 
 
 
390 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2055  oxidoreductase domain-containing protein  37.73 
 
 
390 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3196  oxidoreductase domain-containing protein  36.94 
 
 
392 aa  245  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1885  oxidoreductase domain-containing protein  36.36 
 
 
390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0601915 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1585  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 
375 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  32.58 
 
 
381 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  35.31 
 
 
382 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  31.9 
 
 
381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  34.46 
 
 
382 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 
385 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  32.55 
 
 
386 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  31.99 
 
 
384 aa  179  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  34.88 
 
 
366 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4054  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 
382 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 
384 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  32.64 
 
 
374 aa  170  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  30.87 
 
 
380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  30.53 
 
 
384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 
383 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  29.44 
 
 
383 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  30.14 
 
 
390 aa  162  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 
394 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  30.13 
 
 
384 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  33.67 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  35.05 
 
 
369 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  30.05 
 
 
376 aa  127  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  31.97 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  31.14 
 
 
386 aa  126  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  32.63 
 
 
382 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 
377 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  29.43 
 
 
377 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  30.16 
 
 
347 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  29.27 
 
 
397 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  30.85 
 
 
369 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 
388 aa  119  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>