77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2825 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2825  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1164  hypothetical protein  99.5 
 
 		 210 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2756  hypothetical protein  96.04 
 
 		 202 aa  383  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.014789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0039  hypothetical protein  63.5 
 
 		 210 aa  247  7e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.745199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2911  hypothetical protein  64.4 
 
 		 205 aa  241  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3562  hypothetical protein  61.11 
 
 		 212 aa  232  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2593  hypothetical protein  61.86 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3780  hypothetical protein  46 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0580173  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2069  hypothetical protein  40.31 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.587906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0032  hypothetical protein  43.24 
 
 		 221 aa  141  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3042  hypothetical protein  43.55 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3627  hypothetical protein  45.83 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426525 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0224  hypothetical protein  37.23 
 
 		 246 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0056  hypothetical protein  38.67 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4617  protein of unknown function DUF448  39.38 
 
 		 249 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204222  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1048  hypothetical protein  40.57 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0441  hypothetical protein  39.43 
 
 		 259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2296  protein of unknown function DUF448  35.42 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0327098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2612  hypothetical protein  40.83 
 
 		 257 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150488  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0294  hypothetical protein  39.77 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.211719  decreased coverage  0.00732343 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0023  hypothetical protein  35.06 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  0.0323771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0611  hypothetical protein  35.03 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0129859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0232  hypothetical protein  37.14 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.024742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2924  protein of unknown function DUF448  38.12 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2820  protein of unknown function DUF448  39.23 
 
 		 243 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2698  hypothetical protein  38.12 
 
 		 247 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.430127  normal  0.265509 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3440  hypothetical protein  36.27 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0030  hypothetical protein  35.63 
 
 		 221 aa  101  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1253  hypothetical protein  32.04 
 
 		 211 aa  101  8e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3929  hypothetical protein  38.82 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336833  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0599  hypothetical protein  37.71 
 
 		 275 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3728  hypothetical protein  37.87 
 
 		 240 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  normal  0.0153677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0479  hypothetical protein  36.93 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0748  hypothetical protein  34.24 
 
 		 200 aa  95.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2076  hypothetical protein  32.45 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2164  hypothetical protein  33.15 
 
 		 200 aa  92  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4068  hypothetical protein  34.09 
 
 		 231 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2491  hypothetical protein  31.16 
 
 		 244 aa  88.2  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00369583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3817  hypothetical protein  31.03 
 
 		 246 aa  85.9  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.429858  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0168  hypothetical protein  37.88 
 
 		 231 aa  85.9  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4388  hypothetical protein  34.8 
 
 		 230 aa  85.5  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0962  hypothetical protein  30.81 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.342649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1301  protein of unknown function DUF448  39.37 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000545277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2982  protein of unknown function DUF448  38.58 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1585  50S ribosomal protein L7AE  38.79 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618553  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1900  hypothetical protein  30.73 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0283041  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1668  protein of unknown function DUF448  34.07 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  36.15 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1554  L7Ae family ribosomal protein  30.65 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000328024  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31832  predicted protein  39.25 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.485373 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3728  50S ribosomal protein L7AE  27.07 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.058823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1353  hypothetical protein  32.81 
 
 		 94 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1327  hypothetical protein  32.81 
 
 		 94 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2467  hypothetical protein  38.98 
 
 		 93 aa  48.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000893193  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1153  protein of unknown function DUF448  30.77 
 
 		 96 aa  48.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2045  protein of unknown function DUF448  39.34 
 
 		 96 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3827  hypothetical protein  38.98 
 
 		 90 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33695e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3913  hypothetical protein  38.98 
 
 		 90 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3853  hypothetical protein  38.98 
 
 		 90 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000207203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3862  hypothetical protein  38.98 
 
 		 90 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000195024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3666  hypothetical protein  38.98 
 
 		 93 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000614384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3556  hypothetical protein  38.98 
 
 		 93 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3574  hypothetical protein  38.98 
 
 		 93 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000033301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3952  hypothetical protein  38.98 
 
 		 90 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000117603  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1647  hypothetical protein  31.82 
 
 		 90 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00356058  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3637  hypothetical protein  38.98 
 
 		 90 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000118018  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0834  hypothetical protein  32.79 
 
 		 94 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1331  hypothetical protein  38.98 
 
 		 90 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014271  hitchhiker  0.0000760943 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0993  hypothetical protein  32.1 
 
 		 92 aa  46.2  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000776447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0813  ribosomal protein HS6-type (S12/L30/L7a)  31.4 
 
 		 103 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0074581  hitchhiker  0.00762909 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0697  hypothetical protein  34.67 
 
 		 100 aa  45.4  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302892  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1357  nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  39.53 
 
 		 91 aa  44.3  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  32.94 
 
 		 95 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  27.06 
 
 		 93 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0995  protein of unknown function DUF448  35.06 
 
 		 95 aa  43.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000159922  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl293  hypothetical protein  27.69 
 
 		 103 aa  41.6  0.008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0458979  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2776  hypothetical protein  26.83 
 
 		 91 aa  41.2  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000158399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>