46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2710 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2710  chorismate mutase  100 
 
 		 99 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719316  normal  0.0295757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1049  chorismate mutase  98.99 
 
 		 99 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0180  chorismate mutase  98.82 
 
 		 98 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3880  chorismate mutase  79.8 
 
 		 116 aa  159  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367176  normal  0.891954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2606  chorismate mutase  78.49 
 
 		 102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427343  normal  0.0121912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0750  chorismate mutase  73.47 
 
 		 98 aa  144  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0349  chorismate mutase  71.43 
 
 		 98 aa  139  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.365009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0060  chorismate mutase  61.05 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352497  hitchhiker  0.00833168 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3096  chorismate mutase  67.06 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14790  chorismate mutase  72.84 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165725  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3751  chorismate mutase  63.53 
 
 		 106 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0513  chorismate mutase  64.37 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.575321 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4074  chorismate mutase  63.53 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4204  chorismate mutase  65.88 
 
 		 110 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47894  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2451  chorismate mutase  67.9 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2720  chorismate mutase  66.67 
 
 		 147 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50851  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09580  chorismate mutase  60.44 
 
 		 120 aa  110  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1396  chorismate mutase  63.86 
 
 		 104 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  64.2 
 
 		 107 aa  107  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  64.56 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1352  chorismate mutase  60 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7204  chorismate mutase  59.38 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  60.98 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0652  chorismate mutase  58.7 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0670145  normal  0.113986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0631  chorismate mutase  58.7 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0663  chorismate mutase  58.7 
 
 		 115 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3447  chorismate mutase  56.82 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734851  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3340  chorismate mutase  63.16 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.113481  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1123  chorismate mutase  59.26 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1825  chorismate mutase  64.56 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1757  chorismate mutase  64.56 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  58.97 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24350  monofunctional chorismate mutase  54.32 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.536021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0958  chorismate mutase  54.32 
 
 		 119 aa  91.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.993568 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1199  chorismate mutase  39.56 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0113  chorismate mutase  40.24 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4585  chorismate mutase related enzymes  32.5 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.92 
 
 		 358 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0521  chorismate mutase  31.94 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.38 
 
 		 358 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.38 
 
 		 358 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.63 
 
 		 393 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  35.9 
 
 		 333 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  39.73 
 
 		 375 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  28.75 
 
 		 456 aa  41.2  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2453  hypothetical protein  30.56 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>