More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2582 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0923  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
293 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2582  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
293 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2993  methionine aminopeptidase, type I  94.86 
 
 
293 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0922549 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0117  methionine aminopeptidase, type I  80.15 
 
 
271 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2469  methionine aminopeptidase, type I  80.61 
 
 
271 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.76233  normal  0.0281662 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1979  methionine aminopeptidase, type I  80 
 
 
276 aa  438  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0285  methionine aminopeptidase, type I  77.61 
 
 
269 aa  432  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  65.87 
 
 
263 aa  348  5e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  63.46 
 
 
271 aa  347  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2271  methionine aminopeptidase  63.04 
 
 
278 aa  346  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1512  methionine aminopeptidase  62.79 
 
 
278 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0155  methionine aminopeptidase, type I  60.67 
 
 
274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.368202  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1710  methionine aminopeptidase  63.18 
 
 
278 aa  342  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2897  methionine aminopeptidase, type I  61.8 
 
 
277 aa  342  5e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0829  methionine aminopeptidase  57.3 
 
 
276 aa  340  1e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0450293  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  63.78 
 
 
261 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  61.72 
 
 
279 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1458  methionine aminopeptidase  63.39 
 
 
279 aa  336  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0058  methionine aminopeptidase, type I  58.3 
 
 
274 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0392  methionine aminopeptidase, type I  58.74 
 
 
274 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1455  methionine aminopeptidase  62.26 
 
 
274 aa  334  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.519958  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  59.77 
 
 
273 aa  332  4e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  58.09 
 
 
275 aa  332  6e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_004310  BR1282  methionine aminopeptidase  60.63 
 
 
275 aa  331  9e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1910  methionine aminopeptidase  60.39 
 
 
275 aa  330  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  60.94 
 
 
283 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1245  methionine aminopeptidase  60.63 
 
 
299 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12762  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  61.81 
 
 
276 aa  329  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1644  methionine aminopeptidase, type I  59.38 
 
 
274 aa  328  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828935  normal  0.0725302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0431  methionine aminopeptidase, type I  57.99 
 
 
274 aa  329  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  58.58 
 
 
271 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  60.62 
 
 
277 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1044  methionine aminopeptidase, type I  61.63 
 
 
279 aa  328  7e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  59.16 
 
 
279 aa  325  4.0000000000000003e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0578  methionine aminopeptidase, type I  59.18 
 
 
273 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7381  methionine aminopeptidase, type I  60.16 
 
 
274 aa  321  8e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  57.25 
 
 
274 aa  306  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  56.47 
 
 
274 aa  300  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2206  methionine aminopeptidase, type I  57.94 
 
 
284 aa  300  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2162  methionine aminopeptidase, type I  57.14 
 
 
279 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  55.64 
 
 
275 aa  298  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2482  methionine aminopeptidase, type I  57.14 
 
 
284 aa  297  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  58.47 
 
 
260 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  57.83 
 
 
255 aa  295  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  57.77 
 
 
259 aa  294  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  57.37 
 
 
259 aa  293  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  57.89 
 
 
260 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  56.28 
 
 
261 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  56.28 
 
 
261 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  56.28 
 
 
260 aa  289  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  57.65 
 
 
284 aa  289  4e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  56 
 
 
258 aa  288  9e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  56.63 
 
 
258 aa  286  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  57.49 
 
 
260 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  57.09 
 
 
260 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  57.09 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  56.68 
 
 
261 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  55.47 
 
 
256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  54.26 
 
 
260 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  56.68 
 
 
260 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  54.79 
 
 
270 aa  281  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  53.82 
 
 
266 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  55.47 
 
 
260 aa  280  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  56.28 
 
 
260 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  54.84 
 
 
254 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  54.84 
 
 
254 aa  279  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  54.84 
 
 
258 aa  279  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  53.1 
 
 
260 aa  278  8e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4852  methionine aminopeptidase, type I  55.09 
 
 
271 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838238  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  53.7 
 
 
266 aa  275  5e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  53.94 
 
 
268 aa  275  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  54.94 
 
 
267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  54.44 
 
 
258 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  53.75 
 
 
266 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  52.82 
 
 
258 aa  271  1e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  53.31 
 
 
266 aa  270  1e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  52.82 
 
 
270 aa  271  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  55.51 
 
 
263 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  53.17 
 
 
263 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  55.1 
 
 
275 aa  268  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  54.94 
 
 
263 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  52.29 
 
 
275 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  52.96 
 
 
267 aa  267  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  53.01 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  53.01 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  53.01 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  53.01 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  53.01 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  53.01 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  52.26 
 
 
274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  53.01 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  53.01 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  53.01 
 
 
264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  53.17 
 
 
272 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  53.17 
 
 
273 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  53.17 
 
 
272 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  51.55 
 
 
262 aa  265  5e-70  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  53.17 
 
 
272 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  53.17 
 
 
272 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  53.17 
 
 
272 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>