More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2532 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  100 
 
 		 177 aa  364  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  100 
 
 		 177 aa  364  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  88.14 
 
 		 177 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  68.67 
 
 		 173 aa  252  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  68.64 
 
 		 187 aa  248  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  68.24 
 
 		 174 aa  244  6.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  66.28 
 
 		 174 aa  237  6.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  56.1 
 
 		 175 aa  194  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  52.02 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  52.07 
 
 		 171 aa  190  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  54.27 
 
 		 175 aa  190  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  51.46 
 
 		 193 aa  187  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  56.02 
 
 		 178 aa  187  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  49.41 
 
 		 171 aa  186  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  52.44 
 
 		 175 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  50.89 
 
 		 171 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  53.66 
 
 		 175 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  53.61 
 
 		 177 aa  183  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  48.82 
 
 		 171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  48.82 
 
 		 171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  52 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  50.29 
 
 		 175 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  50.3 
 
 		 172 aa  181  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  50.59 
 
 		 171 aa  179  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  50.29 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  48.11 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  50.29 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  50.88 
 
 		 196 aa  178  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  53.85 
 
 		 176 aa  177  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  51.81 
 
 		 175 aa  177  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  48.26 
 
 		 175 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  48.82 
 
 		 187 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4240  peptide deformylase  52.05 
 
 		 173 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4749  peptide deformylase  51.16 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  50 
 
 		 169 aa  168  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  53.55 
 
 		 173 aa  167  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  48.85 
 
 		 180 aa  167  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  50.6 
 
 		 174 aa  167  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3350  peptide deformylase  55.03 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954138  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  49.39 
 
 		 167 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  50.61 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  50.61 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  48.19 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  50 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  49.11 
 
 		 168 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  49.39 
 
 		 167 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  50 
 
 		 167 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  48.52 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  48.52 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  48.81 
 
 		 169 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  49.09 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  49.1 
 
 		 170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  48.19 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  48.52 
 
 		 168 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  49.11 
 
 		 168 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  47.93 
 
 		 168 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  47.34 
 
 		 168 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  48.17 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  49.08 
 
 		 173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  47.34 
 
 		 168 aa  160  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  49.39 
 
 		 179 aa  159  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  47.06 
 
 		 167 aa  159  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  49.1 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  50.3 
 
 		 168 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  45.2 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  46.15 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  46.99 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2534  peptide deformylase  48.5 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271867  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  45.88 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  49.1 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  46.99 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0346  peptide deformylase  49.11 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0716574  normal  0.0241659 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0645  peptide deformylase  47.59 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.732467  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  47.59 
 
 		 169 aa  158  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  44.97 
 
 		 168 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  48.17 
 
 		 179 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  48.17 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  48.17 
 
 		 167 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  48.17 
 
 		 167 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  44.38 
 
 		 171 aa  157  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  50 
 
 		 177 aa  157  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  50 
 
 		 188 aa  157  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  46.47 
 
 		 170 aa  157  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  49.4 
 
 		 167 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  49.4 
 
 		 179 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  49.4 
 
 		 179 aa  157  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  48.5 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  45.24 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0874  formylmethionine deformylase  46.71 
 
 		 167 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  47.24 
 
 		 173 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0150  peptide deformylase  46.11 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2079  peptide deformylase  45.62 
 
 		 171 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  47.06 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3408  peptide deformylase  46.06 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.709814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  46.95 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  45.18 
 
 		 171 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  47.09 
 
 		 172 aa  154  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  47.34 
 
 		 171 aa  154  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  45.18 
 
 		 171 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  46.43 
 
 		 169 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>