42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2496 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2496  DNA polymerase III, delta  100 
 
 		 330 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0838  DNA polymerase III, delta subunit  98.79 
 
 		 330 aa  644    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3137  DNA polymerase III, delta  91.52 
 
 		 330 aa  591  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  hitchhiker  0.0000037205 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2767  DNA polymerase III, delta subunit  56.34 
 
 		 342 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0043  DNA polymerase III, delta subunit  51.49 
 
 		 342 aa  342  7e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0055  DNA polymerase III, delta subunit  51.67 
 
 		 341 aa  322  5e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000100325 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0409  DNA polymerase III, delta subunit  51.34 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  31.59 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  31.69 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2959  DNA polymerase III, delta subunit  29.6 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0222  DNA polymerase III, delta subunit  27.36 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  28.63 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  27.22 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  28.19 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  28.03 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4096  DNA polymerase III subunit delta  29.52 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0146653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  28.45 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  28.9 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  27.82 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  27.22 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  27.19 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  27.19 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1406  DNA polymerase III subunit delta  29.45 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  26.69 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  26.63 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0077  DNA polymerase III, delta subunit  19.12 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  28.01 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  26.28 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2048  DNA polymerase III subunit delta  34.44 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296688  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2850  DNA polymerase III, delta subunit  29.39 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  26.06 
 
 		 345 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  25.28 
 
 		 347 aa  53.1  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3926  DNA polymerase III subunit delta  26.23 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  28.99 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  25.93 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0126  hypothetical protein  19.05 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3217  DNA polymerase III, delta subunit  24.64 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  27.59 
 
 		 345 aa  46.2  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  21.99 
 
 		 347 aa  44.7  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  27.68 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5028  DNA polymerase III subunit delta  24.79 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  27.44 
 
 		 319 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>