More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2481 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  72.88 
 
 		 434 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  76.9 
 
 		 438 aa  679    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  81.44 
 
 		 431 aa  737    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  73.93 
 
 		 438 aa  642    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  73.7 
 
 		 432 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  72.79 
 
 		 434 aa  647    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  73.22 
 
 		 432 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  77.41 
 
 		 427 aa  691    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  72.68 
 
 		 434 aa  646    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  99.77 
 
 		 431 aa  881    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  96.75 
 
 		 431 aa  855    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  74.52 
 
 		 430 aa  654    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 431 aa  882    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  72.68 
 
 		 434 aa  646    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  74.94 
 
 		 431 aa  656    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2991  serine hydroxymethyltransferase  80.64 
 
 		 439 aa  712    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406931  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  73.88 
 
 		 429 aa  652    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  74.17 
 
 		 439 aa  647    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  84.45 
 
 		 431 aa  754    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  72.81 
 
 		 437 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  74.41 
 
 		 438 aa  646    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  74.52 
 
 		 451 aa  629  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  70.78 
 
 		 433 aa  629  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  70.42 
 
 		 436 aa  626  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3104  serine hydroxymethyltransferase  71.5 
 
 		 433 aa  619  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425727  decreased coverage  0.00549191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  70.78 
 
 		 433 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  70.78 
 
 		 433 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  70.78 
 
 		 432 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  70.62 
 
 		 440 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  72.21 
 
 		 434 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2123  serine hydroxymethyltransferase  72.79 
 
 		 432 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.607283  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  68.65 
 
 		 434 aa  608  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  70.62 
 
 		 435 aa  609  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  72.27 
 
 		 433 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  68.5 
 
 		 432 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  68.74 
 
 		 424 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  68.26 
 
 		 424 aa  599  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1131  serine hydroxymethyltransferase  70.75 
 
 		 438 aa  600  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3844  serine hydroxymethyltransferase  69.93 
 
 		 431 aa  599  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.988817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4649  serine hydroxymethyltransferase  71.26 
 
 		 434 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1979  serine hydroxymethyltransferase  68.5 
 
 		 424 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00954911  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0471  serine hydroxymethyltransferase  68.5 
 
 		 424 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  68.26 
 
 		 424 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2106  serine hydroxymethyltransferase  68.74 
 
 		 424 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3404  serine hydroxymethyltransferase  71.56 
 
 		 433 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  68.74 
 
 		 424 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  68.74 
 
 		 424 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5297  serine hydroxymethyltransferase  71.56 
 
 		 433 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3047  serine hydroxymethyltransferase  70.21 
 
 		 434 aa  600  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302237  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1585  serine hydroxymethyltransferase  68.5 
 
 		 424 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1006  serine hydroxymethyltransferase  68.5 
 
 		 424 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0952  serine hydroxymethyltransferase  70.55 
 
 		 435 aa  595  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000232  serine hydroxymethyltransferase  70.05 
 
 		 431 aa  594  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  67.54 
 
 		 424 aa  594  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5063  serine hydroxymethyltransferase  68.02 
 
 		 424 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0644659  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0710  serine hydroxymethyltransferase  68.26 
 
 		 424 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0571  serine hydroxymethyltransferase  68.97 
 
 		 424 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5200  serine hydroxymethyltransferase  68.74 
 
 		 424 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5085  serine hydroxymethyltransferase  68.74 
 
 		 424 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  68.97 
 
 		 424 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  68.02 
 
 		 424 aa  594  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3283  serine hydroxymethyltransferase  68.74 
 
 		 424 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4497  serine hydroxymethyltransferase  68.74 
 
 		 424 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2283  glycine hydroxymethyltransferase  70.55 
 
 		 425 aa  589  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90339 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05971  serine hydroxymethyltransferase  68.63 
 
 		 431 aa  590  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  69.54 
 
 		 422 aa  586  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0791  serine hydroxymethyltransferase  68.46 
 
 		 435 aa  585  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0375384  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  68.54 
 
 		 420 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  66.43 
 
 		 432 aa  581  1e-164  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0870  glycine hydroxymethyltransferase  70.49 
 
 		 424 aa  579  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  66.34 
 
 		 424 aa  558  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  64.13 
 
 		 434 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  64.1 
 
 		 422 aa  545  1e-154  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  61.2 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4270  serine hydroxymethyltransferase  68.82 
 
 		 423 aa  541  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978969  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5759  glycine hydroxymethyltransferase  63.01 
 
 		 431 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 		 421 aa  531  1e-150  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  65.3 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3135  serine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 434 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  63.86 
 
 		 421 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1142  serine hydroxymethyltransferase  65.41 
 
 		 434 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  64.34 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  65.37 
 
 		 508 aa  528  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  64.03 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  64.34 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  64.82 
 
 		 436 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  65.54 
 
 		 431 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  63.22 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  65.54 
 
 		 431 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 424 aa  524  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  64.82 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  64.58 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  65.06 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 427 aa  521  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  64.82 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  64.27 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  64.58 
 
 		 415 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  64.99 
 
 		 415 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 		 417 aa  523  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>