155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2397 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
344 aa  686  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  99.42 
 
 
344 aa  682  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  91.52 
 
 
344 aa  631  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  68.93 
 
 
349 aa  460  1e-128  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  63.3 
 
 
329 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  61.22 
 
 
349 aa  423  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  58.02 
 
 
340 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  40.82 
 
 
352 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  44.25 
 
 
363 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  43.03 
 
 
371 aa  262  5e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  43.07 
 
 
365 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  43.98 
 
 
342 aa  254  2e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  42.65 
 
 
365 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  41.76 
 
 
349 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  35.74 
 
 
343 aa  239  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  40.6 
 
 
357 aa  235  1e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  40.87 
 
 
400 aa  232  8e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  35.61 
 
 
348 aa  227  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  38.6 
 
 
341 aa  223  5e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  42.41 
 
 
335 aa  219  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  38.44 
 
 
359 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  38.42 
 
 
359 aa  215  1e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  39.88 
 
 
359 aa  213  3e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  37.97 
 
 
357 aa  213  4e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  38.25 
 
 
344 aa  212  6e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  38.53 
 
 
383 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  38.53 
 
 
359 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  38.53 
 
 
359 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  38.53 
 
 
359 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  38.53 
 
 
359 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  38.53 
 
 
359 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  38.51 
 
 
359 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  38.7 
 
 
384 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 
361 aa  202  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  37.85 
 
 
358 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  38.14 
 
 
359 aa  201  2e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  38.14 
 
 
359 aa  201  2e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  37.85 
 
 
359 aa  200  2e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  35.49 
 
 
354 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 
369 aa  200  4e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  35.78 
 
 
352 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  40 
 
 
374 aa  199  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  38.14 
 
 
359 aa  199  8e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  37.39 
 
 
362 aa  198  1e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  37.01 
 
 
359 aa  198  1e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  37.57 
 
 
359 aa  197  2e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  37.86 
 
 
357 aa  196  5e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  33.96 
 
 
394 aa  196  5e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.15 
 
 
357 aa  196  5e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  38.3 
 
 
331 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  34.38 
 
 
354 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  35.95 
 
 
366 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  33.14 
 
 
354 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  36.31 
 
 
358 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  33.23 
 
 
354 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  37.73 
 
 
326 aa  186  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4200  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 
363 aa  182  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.48581e-06 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  33.82 
 
 
354 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  36.71 
 
 
356 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  30.94 
 
 
321 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  29.7 
 
 
321 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  30.7 
 
 
353 aa  121  2e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  32.06 
 
 
331 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  28.26 
 
 
324 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  31.69 
 
 
329 aa  112  7e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  27.83 
 
 
324 aa  112  1e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  33.53 
 
 
324 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  27.84 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  30.96 
 
 
337 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 
318 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  30.94 
 
 
332 aa  86.7  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.44 
 
 
346 aa  85.5  1e-15  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  23.99 
 
 
310 aa  84.3  3e-15  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
320 aa  83.2  6e-15  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  29.92 
 
 
368 aa  82.4  1e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 
334 aa  82  1e-14  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 
314 aa  82  1e-14  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  29.84 
 
 
335 aa  81.3  2e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 
339 aa  81.3  2e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  26.17 
 
 
328 aa  80.1  5e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  25.87 
 
 
317 aa  77.4  3e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  23.4 
 
 
322 aa  77.8  3e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  24.25 
 
 
323 aa  77.4  3e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  29.67 
 
 
348 aa  76.6  6e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 
346 aa  73.2  6e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  24.25 
 
 
350 aa  72.8  7e-12  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  2.71524e-08  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  21.64 
 
 
324 aa  72  1e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.97877e-05 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  26.25 
 
 
317 aa  72  1e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1928  beta-lactamase domain protein  28.88 
 
 
315 aa  72  1e-11  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  23.42 
 
 
325 aa  72  1e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 
366 aa  72  1e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  24.86 
 
 
317 aa  71.2  2e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  28.85 
 
 
332 aa  70.9  3e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  25.96 
 
 
317 aa  71.2  3e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 
328 aa  70.9  3e-11  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6747  hypothetical protein  40.91 
 
 
214 aa  70.5  4e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0405186  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  25.96 
 
 
317 aa  70.5  4e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  25.96 
 
 
317 aa  70.1  5e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  25.96 
 
 
317 aa  70.1  5e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>