More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2305 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 328 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  99.09 
 
 		 328 aa  670    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  92.68 
 
 		 328 aa  614  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  71.78 
 
 		 332 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  67.18 
 
 		 327 aa  450  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  54.52 
 
 		 332 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  54.83 
 
 		 332 aa  355  5e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  52.65 
 
 		 323 aa  345  8.999999999999999e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  54.06 
 
 		 330 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  53.75 
 
 		 330 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  53.75 
 
 		 330 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  52.02 
 
 		 332 aa  334  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  51.55 
 
 		 333 aa  334  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  53.29 
 
 		 332 aa  332  8e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  51.69 
 
 		 329 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 328 aa  329  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 		 332 aa  329  4e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  50.31 
 
 		 337 aa  328  6e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 		 324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 332 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  46.63 
 
 		 326 aa  323  2e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 332 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  46.15 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  48.43 
 
 		 321 aa  320  3e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  48.17 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  47.19 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  51.27 
 
 		 328 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  50.62 
 
 		 329 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  49.05 
 
 		 328 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  46.13 
 
 		 333 aa  314  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  47.52 
 
 		 329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  49.22 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 330 aa  309  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 330 aa  309  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 330 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 330 aa  309  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  47.17 
 
 		 328 aa  308  6.999999999999999e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 330 aa  308  8e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 		 330 aa  308  8e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  47.17 
 
 		 328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  44.44 
 
 		 324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 		 331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  47.99 
 
 		 324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  47.62 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  47.69 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  48.59 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  45.62 
 
 		 330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  47.69 
 
 		 328 aa  302  6.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  49.06 
 
 		 329 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  47.84 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  45.6 
 
 		 328 aa  299  3e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  44.51 
 
 		 327 aa  298  7e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  49.06 
 
 		 330 aa  298  9e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  47.8 
 
 		 329 aa  298  9e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  47.95 
 
 		 320 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  48.74 
 
 		 329 aa  295  6e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  45.91 
 
 		 331 aa  294  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  48.31 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  47.96 
 
 		 331 aa  291  8e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  44.18 
 
 		 348 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  47.5 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  47.58 
 
 		 349 aa  289  6e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 		 316 aa  288  7e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  45.82 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  45.74 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  48.44 
 
 		 328 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  44.65 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  45.48 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  47.02 
 
 		 329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  48.28 
 
 		 356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  42.63 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  44.83 
 
 		 327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  48.75 
 
 		 327 aa  282  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 321 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  45.82 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 321 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  47.38 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2760  UDP-galactose 4-epimerase  49.69 
 
 		 330 aa  279  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  49.06 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  45.23 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  47.81 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  45.79 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  44.65 
 
 		 330 aa  275  8e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  44.65 
 
 		 330 aa  275  8e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  44.95 
 
 		 327 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>