285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2190 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5923  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain, nifK  62.81 
 
 
519 aa  697    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0231  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  61.66 
 
 
519 aa  700    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1238  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  63.97 
 
 
519 aa  717    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3536  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  70.7 
 
 
512 aa  787    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3630  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  61.85 
 
 
519 aa  702    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  57.5 
 
 
512 aa  646    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3994  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  70.31 
 
 
512 aa  780    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5054  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  69.79 
 
 
513 aa  763    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  100 
 
 
506 aa  1062    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0090  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  62.62 
 
 
519 aa  704    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  70.96 
 
 
513 aa  779    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1432  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  58.77 
 
 
519 aa  660    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1012  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  69.61 
 
 
510 aa  757    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245367  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  100 
 
 
516 aa  1083    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  93.68 
 
 
506 aa  1008    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0971  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  62.24 
 
 
519 aa  704    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1607  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  58.96 
 
 
519 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262136  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4461  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  62.36 
 
 
518 aa  694    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1467  nitrogenase, molybdenum-iron protein beta chain(NifK)  58.77 
 
 
519 aa  669    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261912  hitchhiker  0.00055229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1075  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  61.07 
 
 
537 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.902597  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  71.09 
 
 
511 aa  788    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1520  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  63.97 
 
 
519 aa  717    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.268449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5099  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  62.04 
 
 
519 aa  706    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  57.61 
 
 
519 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2343  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  58.96 
 
 
519 aa  663    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303723  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4932  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  70.39 
 
 
510 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0475  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  59.62 
 
 
520 aa  679    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  58.28 
 
 
511 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  57.78 
 
 
511 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  58.28 
 
 
511 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  57.5 
 
 
511 aa  627  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4138  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  57.95 
 
 
512 aa  613  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453924  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  55.62 
 
 
512 aa  610  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  56.21 
 
 
511 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  55.23 
 
 
518 aa  588  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  55.62 
 
 
518 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1413  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  52.68 
 
 
522 aa  560  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  51.53 
 
 
523 aa  553  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.47 
 
 
523 aa  535  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  50.68 
 
 
524 aa  529  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0493  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.05 
 
 
522 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.89 
 
 
487 aa  497  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  49.69 
 
 
489 aa  498  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  48.73 
 
 
489 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  48.31 
 
 
489 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  47.86 
 
 
487 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  47.66 
 
 
487 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  46.65 
 
 
489 aa  473  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  46.88 
 
 
487 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  46.98 
 
 
487 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  47.91 
 
 
489 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1051  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  47.86 
 
 
472 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.94 
 
 
459 aa  351  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2617  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.27 
 
 
458 aa  348  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  41.27 
 
 
463 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.05 
 
 
461 aa  348  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.52 
 
 
461 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0838  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40 
 
 
458 aa  344  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  40.13 
 
 
456 aa  344  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.58 
 
 
460 aa  343  4e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.78 
 
 
455 aa  342  7e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.86 
 
 
485 aa  342  1e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.78 
 
 
455 aa  340  4e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.34 
 
 
460 aa  339  9e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.95 
 
 
459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.91 
 
 
459 aa  336  5e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1015  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.27 
 
 
458 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.61 
 
 
460 aa  322  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  38 
 
 
461 aa  318  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  37.78 
 
 
462 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  37.07 
 
 
458 aa  301  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  37.78 
 
 
462 aa  300  4e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  37.78 
 
 
462 aa  299  7e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  36.7 
 
 
458 aa  298  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  36.61 
 
 
458 aa  297  4e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  36.38 
 
 
458 aa  296  7e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  37.5 
 
 
490 aa  293  6e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  37.92 
 
 
462 aa  291  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  38.15 
 
 
472 aa  286  9e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  34.84 
 
 
475 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  33.71 
 
 
477 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  34.47 
 
 
475 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  34.38 
 
 
451 aa  249  7e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1029  Nitrogenase  34.22 
 
 
466 aa  247  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02590  vanadium nitrogenase beta subunit, vnfK  36.16 
 
 
475 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  34.68 
 
 
461 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  33.48 
 
 
462 aa  236  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1757  Nitrogenase  33.33 
 
 
457 aa  236  9e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0799606  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  33.77 
 
 
456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  32.95 
 
 
479 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1551  nitrogenase, subunit K  34.35 
 
 
462 aa  227  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  31.36 
 
 
450 aa  225  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1392  nitrogenase  33.49 
 
 
462 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392625  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2613  Fe-only nitrogenase, beta subunit  34 
 
 
462 aa  224  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  32.14 
 
 
450 aa  224  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0679  Nitrogenase  33.26 
 
 
451 aa  223  6e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0432483  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  34.82 
 
 
463 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1534  nitrogenase  32.14 
 
 
450 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.898228  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1620  Fe-only nitrogenase, beta subunit  32.89 
 
 
461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.855819  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1250  nitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein NifN, putative  32.59 
 
 
452 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>