164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2100 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  98.5 
 
 		 200 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  93.5 
 
 		 204 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  71.35 
 
 		 201 aa  286  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  55.05 
 
 		 208 aa  218  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  51.55 
 
 		 210 aa  205  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  51.3 
 
 		 210 aa  201  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  48.99 
 
 		 215 aa  198  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  51.28 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  48.97 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  48.97 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  47.4 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  50.77 
 
 		 211 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  46.88 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  47.96 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  46.35 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  47.15 
 
 		 212 aa  174  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  50 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  48.22 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  46.46 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  45.18 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  48.21 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  48.73 
 
 		 211 aa  167  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  45.05 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  48.72 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  46.34 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  42.27 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  47.69 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  45.03 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  45.03 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  43.22 
 
 		 235 aa  162  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  45.64 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  45.64 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  44.27 
 
 		 238 aa  159  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  47.42 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  47.12 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  51.28 
 
 		 239 aa  155  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  46.35 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  40.21 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  40.41 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  45.83 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  41.03 
 
 		 234 aa  145  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  39.79 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  44.04 
 
 		 237 aa  141  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  40.51 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  41.97 
 
 		 203 aa  138  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  41.24 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  37.37 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  39.06 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  40.1 
 
 		 200 aa  118  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  37.63 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  41.67 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  41.88 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  38.51 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  36.65 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  34.03 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  39.11 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  38.85 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  46.39 
 
 		 109 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  31.03 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2263  Protein of unknown function DUF2179  30.59 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  24.59 
 
 		 294 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  32.24 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0393  hypothetical protein  32.56 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0494  hypothetical protein  28.74 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  26.62 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  27.67 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0389  hypothetical protein  31.01 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  28.57 
 
 		 281 aa  58.2  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3548  protein of unknown function DUF161  33.77 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.979757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0167  Protein of unknown function DUF2179  28.21 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0817  hypothetical protein  26.83 
 
 		 287 aa  57  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  28.96 
 
 		 292 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  25.27 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1947  hypothetical protein  29.46 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  27.15 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2107  Protein of unknown function DUF2179  29.61 
 
 		 289 aa  54.3  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0670026 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2225  hypothetical protein  26.79 
 
 		 309 aa  54.3  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.22076  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  30.83 
 
 		 292 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3612  hypothetical protein  26.38 
 
 		 297 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  30.41 
 
 		 296 aa  53.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2170  hypothetical protein  27.07 
 
 		 290 aa  52.8  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000241108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  26.99 
 
 		 311 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  27.1 
 
 		 288 aa  53.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5178  hypothetical protein  25.77 
 
 		 297 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5163  hypothetical protein  25.77 
 
 		 297 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4891  hypothetical protein  25.77 
 
 		 297 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4733  hypothetical protein  25.77 
 
 		 297 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4748  hypothetical protein  25.77 
 
 		 297 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5265  hypothetical protein  25.77 
 
 		 297 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5133  hypothetical protein  25.77 
 
 		 297 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  29.76 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5168  hypothetical protein  25.15 
 
 		 297 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2862  protein of unknown function DUF161  30.11 
 
 		 287 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0080  hypothetical protein  25.15 
 
 		 297 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  28.48 
 
 		 323 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  25.31 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  26.92 
 
 		 290 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4850  hypothetical protein  25.15 
 
 		 297 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1308  hypothetical protein  26.7 
 
 		 288 aa  49.7  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>