More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1999 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0355  serine protease  99.59 
 
 
493 aa  977  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  100 
 
 
506 aa  1005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  91.28 
 
 
493 aa  865  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  65.98 
 
 
499 aa  617  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  68.93 
 
 
501 aa  616  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  65.66 
 
 
514 aa  593  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  63.7 
 
 
515 aa  551  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  50.63 
 
 
487 aa  448  1e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  51.04 
 
 
500 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  46.08 
 
 
524 aa  417  1e-115  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  46.08 
 
 
524 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  50.11 
 
 
501 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  49.25 
 
 
528 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  45.86 
 
 
520 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  50.97 
 
 
511 aa  408  1e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  49.68 
 
 
471 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  46.63 
 
 
578 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  47.49 
 
 
588 aa  401  1e-110  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  50.43 
 
 
516 aa  399  1e-110  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  48.65 
 
 
498 aa  399  1e-110  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  46.56 
 
 
522 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  50.87 
 
 
498 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  49.28 
 
 
499 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  47.26 
 
 
508 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  47.39 
 
 
497 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  50.21 
 
 
511 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  48.21 
 
 
502 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  50.32 
 
 
511 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  49.57 
 
 
501 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  45.6 
 
 
496 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  46.74 
 
 
497 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  47.49 
 
 
491 aa  378  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  45.92 
 
 
523 aa  378  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  47.2 
 
 
535 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  48.35 
 
 
498 aa  369  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  42.53 
 
 
496 aa  361  1e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  44.86 
 
 
483 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  44.86 
 
 
483 aa  360  5e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  45.42 
 
 
483 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  45.26 
 
 
459 aa  358  9e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  43.69 
 
 
457 aa  355  8e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  43.72 
 
 
523 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  43.35 
 
 
520 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  44.01 
 
 
523 aa  353  4e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  42.65 
 
 
513 aa  353  5e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  42.65 
 
 
513 aa  353  5e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  42.77 
 
 
517 aa  352  8e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  42.98 
 
 
526 aa  352  9e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  43.95 
 
 
528 aa  352  9e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  44.49 
 
 
506 aa  351  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  42.12 
 
 
527 aa  347  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  41.68 
 
 
464 aa  346  7e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.6609e-07  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  44.21 
 
 
502 aa  345  8e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  45.05 
 
 
458 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  44.38 
 
 
500 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  42.58 
 
 
505 aa  343  5e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  43.84 
 
 
504 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  43.42 
 
 
501 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  44.23 
 
 
516 aa  340  3e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  43.53 
 
 
473 aa  340  5e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  41.31 
 
 
527 aa  339  6e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  42.95 
 
 
529 aa  337  3e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  41.7 
 
 
527 aa  336  6e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  44.32 
 
 
476 aa  336  7e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  41.3 
 
 
520 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  41.99 
 
 
501 aa  334  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  41.42 
 
 
528 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  41.44 
 
 
518 aa  332  8e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  41.26 
 
 
508 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  44.1 
 
 
473 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  42.68 
 
 
503 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  42.5 
 
 
496 aa  330  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  42.46 
 
 
503 aa  329  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  41.67 
 
 
476 aa  328  1e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  45.24 
 
 
509 aa  328  1e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  42.42 
 
 
480 aa  328  2e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  40.92 
 
 
464 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  43.66 
 
 
475 aa  327  4e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  42.24 
 
 
501 aa  326  6e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  42.27 
 
 
485 aa  325  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  39.16 
 
 
466 aa  323  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  8.36052e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  42.37 
 
 
525 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  42.73 
 
 
496 aa  322  7e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  41.96 
 
 
524 aa  322  1e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  42.92 
 
 
496 aa  322  1e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  41.8 
 
 
492 aa  322  1e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  42.59 
 
 
479 aa  322  1e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  40.33 
 
 
489 aa  321  2e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  2.25032e-08  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  41.98 
 
 
485 aa  320  6e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  40.86 
 
 
477 aa  319  8e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  41.02 
 
 
479 aa  319  8e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  41.19 
 
 
477 aa  319  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  41.07 
 
 
491 aa  319  9e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  41.09 
 
 
461 aa  317  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  43.01 
 
 
481 aa  316  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  42.73 
 
 
482 aa  316  7e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  42.48 
 
 
502 aa  315  1e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  40.64 
 
 
473 aa  315  2e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  42.92 
 
 
502 aa  314  3e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  9.01531e-09  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  41.74 
 
 
481 aa  312  9e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>