More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1962 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  99.78 
 
 
452 aa  930    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  94.03 
 
 
452 aa  884    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
452 aa  934    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  52.99 
 
 
451 aa  473  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  51.98 
 
 
453 aa  442  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  50.78 
 
 
451 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  47.51 
 
 
450 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  46.98 
 
 
450 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  47.06 
 
 
450 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3859  coproporphyrinogen III oxidase  45.52 
 
 
442 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652374  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  44.67 
 
 
450 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.33 
 
 
451 aa  364  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  45.12 
 
 
454 aa  363  3e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  41.45 
 
 
449 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.96 
 
 
470 aa  361  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  42.27 
 
 
469 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.73 
 
 
467 aa  355  7.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.69 
 
 
490 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  43.98 
 
 
450 aa  352  7e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  41.45 
 
 
449 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  42.62 
 
 
449 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  41.22 
 
 
449 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  43.22 
 
 
450 aa  349  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  40.38 
 
 
450 aa  348  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  40.51 
 
 
451 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.96 
 
 
456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  42.56 
 
 
480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.38 
 
 
444 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  41.92 
 
 
444 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  41 
 
 
448 aa  329  7e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.29 
 
 
454 aa  327  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  40.05 
 
 
444 aa  326  7e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  40.05 
 
 
444 aa  326  7e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0606  coproporphyrinogen III oxidase  38.69 
 
 
455 aa  322  8e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  38.93 
 
 
450 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  38.75 
 
 
450 aa  320  5e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 
451 aa  316  5e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  38.04 
 
 
453 aa  316  7e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.72 
 
 
457 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  37.65 
 
 
453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.84 
 
 
462 aa  310  4e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  38.25 
 
 
489 aa  309  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  38.62 
 
 
510 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  36.38 
 
 
451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  39.74 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  37.79 
 
 
500 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  36.38 
 
 
451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.91 
 
 
462 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  37.18 
 
 
453 aa  304  3.0000000000000004e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  38.13 
 
 
494 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  38.36 
 
 
494 aa  302  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  35.92 
 
 
451 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  38.48 
 
 
483 aa  299  6e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0878  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.56 
 
 
461 aa  299  9e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 
481 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 
483 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.17 
 
 
458 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  38.26 
 
 
483 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.83 
 
 
478 aa  296  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1695  coproporphyrinogen III oxidase  36.24 
 
 
452 aa  296  6e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  38.03 
 
 
481 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  37.58 
 
 
468 aa  296  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.57 
 
 
465 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  38.03 
 
 
483 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.24 
 
 
457 aa  295  1e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  36.32 
 
 
460 aa  295  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  38.03 
 
 
483 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  36.12 
 
 
458 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3913  coproporphyrinogen III oxidase  37.16 
 
 
446 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  36.4 
 
 
458 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  36.4 
 
 
458 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  38.58 
 
 
487 aa  293  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3911  coproporphyrinogen III oxidase  37.16 
 
 
446 aa  292  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0495726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  36.62 
 
 
458 aa  292  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  36.16 
 
 
446 aa  292  8e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4730  coproporphyrinogen III oxidase  36.64 
 
 
458 aa  291  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  38.04 
 
 
481 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  38.84 
 
 
463 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  38.84 
 
 
463 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  38.17 
 
 
464 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4116  coproporphyrinogen III oxidase  37.16 
 
 
446 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  37.12 
 
 
457 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.12 
 
 
457 aa  291  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  37.12 
 
 
457 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0047  coproporphyrinogen III oxidase  36.93 
 
 
446 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577126  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 
464 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  37.12 
 
 
457 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  37.12 
 
 
457 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  38.39 
 
 
464 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4493  coproporphyrinogen III oxidase  36.93 
 
 
446 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.320649 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  37.39 
 
 
460 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4351  coproporphyrinogen III oxidase  36.93 
 
 
446 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  36.6 
 
 
457 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4003  coproporphyrinogen III oxidase  37.16 
 
 
446 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.258904 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4296  coproporphyrinogen III oxidase  36.93 
 
 
446 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000258009 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  34.86 
 
 
455 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  37.12 
 
 
457 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  37.12 
 
 
457 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  37.12 
 
 
457 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  38.17 
 
 
464 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>