79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1960 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0315  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  100 
 
 
459 aa  892    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1960  PUCC protein  100 
 
 
459 aa  892    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.77527  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0979  PUCC protein  92.81 
 
 
459 aa  845    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1583  PUCC protein  60.22 
 
 
465 aa  486  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652092  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3083  chlorophyll major facilitator superfamily (MFS) exporter PucC  57.48 
 
 
475 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3787  PUCC protein  56.43 
 
 
483 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2898  pucC  56.95 
 
 
467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4031  PucC protein, chlorophyll MFS exporter  57.45 
 
 
473 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.344544  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3785  PUCC protein  57.24 
 
 
475 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2398  PUCC protein  57.02 
 
 
475 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.6432  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1680  PUCC protein  56.47 
 
 
478 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4446  PucC chlorophyll MFS exporter  58.8 
 
 
473 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1240  PUCC protein  57.72 
 
 
484 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000359132  unclonable  0.0000000283623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0618  PUCC protein  52.08 
 
 
480 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6412  photosynthetic complex (LH1) assembly protein LhaA  53.45 
 
 
477 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2037  PUCC protein  52.19 
 
 
476 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1735  PUCC protein  52.27 
 
 
477 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3976  LhaA protein  53.13 
 
 
477 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1318  PUCC protein  53.46 
 
 
477 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  0.172961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5356  PUCC protein  52.42 
 
 
481 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4811  PUCC protein  52.2 
 
 
481 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3731  PUCC protein  51.84 
 
 
477 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.532821  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5278  PUCC protein  51.98 
 
 
481 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3723  PUCC protein  51.78 
 
 
476 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0690908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1843  PUCC protein  50.77 
 
 
475 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.085296 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3539  PUCC protein  49.57 
 
 
481 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0156  PUCC protein  49.12 
 
 
478 aa  330  5.0000000000000004e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1933  PUCC protein  49.66 
 
 
479 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1632  PUCC protein  44.7 
 
 
475 aa  325  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369944  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1005  PUCC protein  49.13 
 
 
479 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0290  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  49.44 
 
 
479 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2807  PUCC protein  36.25 
 
 
472 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2893  PUCC protein  35.91 
 
 
474 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00562586  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3165  PUCC protein  34.27 
 
 
474 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360392  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1287  PUCC protein  31.11 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1903  PUCC protein  32.8 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3432  PUCC protein  31.47 
 
 
434 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0654139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1022  PUCC protein  31.7 
 
 
434 aa  153  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1543  PUCC protein  33.81 
 
 
433 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000848404 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0990  PUCC protein  29.81 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3991  light harvesting pigment MFS transporter Bch2  28.73 
 
 
447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  normal  0.25213 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03411  Na+/melibiose symporter  29.09 
 
 
472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0355  PUCC protein  29.23 
 
 
488 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1720  PUCC protein  28.24 
 
 
438 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3746  PUCC protein  28.08 
 
 
447 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00047851 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0911  PUCC protein  29.43 
 
 
449 aa  123  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.592939  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1303  PUCC protein  28.06 
 
 
452 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0459  PUCC protein  27.47 
 
 
478 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.222585  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3529  PUCC protein  29.86 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.513682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0518  PUCC protein  28.77 
 
 
449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3332  PUCC protein  26.53 
 
 
481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1668  PUCC protein  27.88 
 
 
448 aa  113  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5366  PUCC protein  28.7 
 
 
455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238327  normal  0.20788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0028  PUCC protein  25.23 
 
 
477 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.30591  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1017  PUCC protein  27.05 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0689  PucC protein  28.19 
 
 
448 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.85813  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  27.34 
 
 
450 aa  109  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1461  PucC protein  29.81 
 
 
449 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833113  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0278  putative light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC  28.17 
 
 
427 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2062  PUCC protein  28.01 
 
 
455 aa  107  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.035842 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1921  PUCC protein  28.17 
 
 
427 aa  107  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.824161 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1849  PUCC protein  28.02 
 
 
448 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1762  hypothetical protein  26.42 
 
 
483 aa  103  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0658  PUCC protein  27.63 
 
 
472 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.573961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6423  light harvesting pigment major facilitator family (MFS) transporter, Bch2-like protein  26.9 
 
 
444 aa  103  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1601  PUCC protein  29.95 
 
 
447 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1707  PUCC protein  26.57 
 
 
487 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1689  PUCC protein  26.57 
 
 
487 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0628  PUCC protein  28.26 
 
 
449 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1853  PUCC protein  30.25 
 
 
512 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3713  PUCC protein  32.88 
 
 
448 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368833  hitchhiker  0.000507532 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4821  PUCC protein  27.4 
 
 
459 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1534  PUCC protein  26.9 
 
 
457 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00123663  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1652  light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC-like  26.15 
 
 
459 aa  91.3  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5288  PUCC protein  26.65 
 
 
458 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212977  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1912  PUCC protein  26.45 
 
 
457 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.199112  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0166  PUCC protein  28.41 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3131  PUCC protein  25.11 
 
 
452 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400987  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0707  hypothetical protein  28.5 
 
 
463 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>