174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1762 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0125  glucan biosynthesis protein G  100 
 
 
540 aa  1097    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1762  glucan biosynthesis protein G  100 
 
 
540 aa  1097    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  89.07 
 
 
540 aa  976    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  53.16 
 
 
534 aa  501  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  41.91 
 
 
597 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  41.1 
 
 
604 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  42.63 
 
 
530 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  44.1 
 
 
498 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  40.92 
 
 
604 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  40.92 
 
 
558 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  42.07 
 
 
594 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  41.24 
 
 
534 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  40.33 
 
 
562 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  41.92 
 
 
568 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  40.33 
 
 
562 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  40.33 
 
 
608 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  40.33 
 
 
562 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  42.86 
 
 
533 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  45.09 
 
 
528 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  42.8 
 
 
495 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  41.54 
 
 
534 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  41.34 
 
 
534 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  40.77 
 
 
536 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  42.62 
 
 
588 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  42.42 
 
 
525 aa  369  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  41.76 
 
 
503 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3185  glucan biosynthesis protein D  45.02 
 
 
527 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  41.53 
 
 
525 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  41.53 
 
 
525 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  42.33 
 
 
534 aa  362  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  40.86 
 
 
517 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  40.86 
 
 
517 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  40.86 
 
 
517 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  40.86 
 
 
517 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  40.45 
 
 
511 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  40.45 
 
 
517 aa  361  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  40.45 
 
 
511 aa  361  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  40.45 
 
 
511 aa  361  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  40.45 
 
 
517 aa  361  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  40.86 
 
 
517 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  40.45 
 
 
511 aa  361  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  40.45 
 
 
511 aa  361  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  40.45 
 
 
517 aa  361  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  40.45 
 
 
511 aa  361  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  40.86 
 
 
533 aa  358  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  42.33 
 
 
537 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  39.55 
 
 
511 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  39.55 
 
 
528 aa  357  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  40.65 
 
 
559 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  40.43 
 
 
579 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  41.44 
 
 
530 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  41.56 
 
 
504 aa  355  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  41.44 
 
 
520 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  39.92 
 
 
522 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  39.88 
 
 
505 aa  351  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  39.78 
 
 
559 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  41.6 
 
 
532 aa  350  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3187  glucan biosynthesis protein D  43.8 
 
 
531 aa  350  5e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  40.04 
 
 
522 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  39.62 
 
 
503 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3925  glucan biosynthesis protein D  43.8 
 
 
527 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324166  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  39.35 
 
 
579 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  41.06 
 
 
559 aa  346  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  39.84 
 
 
522 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  39.15 
 
 
517 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  41.82 
 
 
514 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  42.92 
 
 
542 aa  343  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  38.82 
 
 
641 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  39.96 
 
 
604 aa  342  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  38.89 
 
 
522 aa  341  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  41.1 
 
 
519 aa  341  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  38.69 
 
 
642 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2785  glucan biosynthesis protein G  43.64 
 
 
522 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  39.07 
 
 
545 aa  340  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  39.07 
 
 
545 aa  340  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  39.07 
 
 
545 aa  340  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  41.43 
 
 
560 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  40.75 
 
 
545 aa  339  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  37.43 
 
 
546 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  38.48 
 
 
542 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  38.48 
 
 
542 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  43.47 
 
 
507 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  38.04 
 
 
519 aa  337  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  38.29 
 
 
542 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  38.29 
 
 
542 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  39.92 
 
 
498 aa  336  7e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  38.27 
 
 
522 aa  335  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  39.55 
 
 
511 aa  335  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  41.24 
 
 
544 aa  334  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  39.19 
 
 
537 aa  333  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  39.19 
 
 
537 aa  333  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1534  glucan biosynthesis protein G  43.3 
 
 
508 aa  332  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  41.43 
 
 
560 aa  331  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  41.12 
 
 
518 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  39.21 
 
 
540 aa  329  6e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  37.52 
 
 
543 aa  325  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  38.52 
 
 
551 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03975  glucan biosynthesis protein G  37.97 
 
 
543 aa  323  5e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  39.93 
 
 
540 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1302  glucan biosynthesis protein G  37.35 
 
 
530 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>