More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1747 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1747  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
486 aa  942    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.308611  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1700  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  96.3 
 
 
486 aa  856    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0282324  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1358  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  65.06 
 
 
481 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199626  normal  0.187922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1337  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  64.44 
 
 
481 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210293  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4732  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  63.41 
 
 
480 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708423  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4060  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  63.23 
 
 
480 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.40537  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1503  NADH dehydrogenase subunit M  42.53 
 
 
511 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3297  NADH dehydrogenase subunit M  40.57 
 
 
509 aa  339  5.9999999999999996e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.416453 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1010  NADH dehydrogenase subunit M  41.92 
 
 
514 aa  339  7e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1465  NADH dehydrogenase subunit M  40 
 
 
510 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1571  NADH dehydrogenase subunit M  40 
 
 
510 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1805  NADH dehydrogenase subunit M  40 
 
 
510 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.168858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02202  NADH dehydrogenase subunit M  41.41 
 
 
509 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.786903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.41 
 
 
509 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2426  NADH dehydrogenase subunit M  41.41 
 
 
509 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2570  NADH dehydrogenase subunit M  41.41 
 
 
509 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2431  NADH dehydrogenase subunit M  41.41 
 
 
509 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3416  NADH dehydrogenase subunit M  41.41 
 
 
509 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3121  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.85 
 
 
513 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0441802  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1375  NADH dehydrogenase subunit M  41.41 
 
 
509 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02162  hypothetical protein  41.41 
 
 
509 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2653  NADH dehydrogenase subunit M  41.21 
 
 
509 aa  335  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2761  NADH dehydrogenase subunit M  41.81 
 
 
511 aa  334  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29860  NADH dehydrogenase subunit M  44.11 
 
 
509 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000573313  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2558  NADH dehydrogenase subunit M  43.9 
 
 
509 aa  332  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2545  NADH dehydrogenase subunit M  40.93 
 
 
509 aa  333  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2556  NADH dehydrogenase subunit M  40.93 
 
 
509 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2663  NADH dehydrogenase subunit M  40.93 
 
 
509 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2501  NADH dehydrogenase subunit M  40.93 
 
 
509 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2456  NADH dehydrogenase subunit M  40.93 
 
 
509 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2423  NADH dehydrogenase subunit M  43.87 
 
 
509 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28550  NADH dehydrogenase subunit M  43.15 
 
 
509 aa  329  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1405  NADH dehydrogenase subunit M  41.68 
 
 
532 aa  329  8e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2821  NADH dehydrogenase subunit M  41.33 
 
 
509 aa  325  8.000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2539  NADH dehydrogenase subunit M  40.6 
 
 
511 aa  325  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1348  NADH dehydrogenase I, M subunit  44.68 
 
 
489 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.467461  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1024  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.84 
 
 
500 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.272198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1862  NADH dehydrogenase subunit M  43.27 
 
 
510 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  0.0328463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1109  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.78 
 
 
505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3614  NADH dehydrogenase subunit M  42.36 
 
 
510 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166771  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3208  NADH dehydrogenase subunit M  42.15 
 
 
510 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281414  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3702  NADH dehydrogenase subunit M  42.8 
 
 
510 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.65414  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4130  NADH dehydrogenase subunit M  42.58 
 
 
510 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2871  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.73 
 
 
537 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0408599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3376  NADH dehydrogenase I, M subunit  42.92 
 
 
510 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1735  NADH dehydrogenase subunit M  42.58 
 
 
510 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00591275  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1116  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.72 
 
 
493 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3814  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.96 
 
 
490 aa  297  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0595  NADH dehydrogenase subunit M  36.49 
 
 
541 aa  297  3e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000354161  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0584  NADH dehydrogenase subunit M  36.61 
 
 
541 aa  296  4e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0370  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.9 
 
 
507 aa  284  3.0000000000000004e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3430  NADH dehydrogenase I, M subunit  39.87 
 
 
496 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0707  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.31 
 
 
493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.296941  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1958  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  35.71 
 
 
501 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0280811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.98 
 
 
507 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.2 
 
 
497 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  36.6 
 
 
515 aa  270  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1886  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  36.61 
 
 
532 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000163526 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1688  NADH dehydrogenase subunit M  35.12 
 
 
577 aa  270  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.694136  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  36.97 
 
 
513 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2882  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  35.41 
 
 
534 aa  269  8e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0314  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.94 
 
 
493 aa  269  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  35.53 
 
 
521 aa  269  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  36.03 
 
 
503 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  37 
 
 
513 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2796  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  34.94 
 
 
537 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.49 
 
 
505 aa  266  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  37 
 
 
513 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  36.12 
 
 
494 aa  266  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.12 
 
 
494 aa  266  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  34.71 
 
 
489 aa  266  8e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  35.33 
 
 
502 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  36.83 
 
 
491 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  35.82 
 
 
503 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  35.33 
 
 
502 aa  264  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  36.09 
 
 
501 aa  264  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  35.32 
 
 
510 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  33.6 
 
 
522 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10561  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  36.42 
 
 
523 aa  263  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  35.79 
 
 
512 aa  262  8.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0171  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.05 
 
 
496 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.33 
 
 
519 aa  259  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  34.92 
 
 
502 aa  259  7e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  32.93 
 
 
535 aa  257  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.26 
 
 
495 aa  256  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  36.12 
 
 
514 aa  256  5e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  34.38 
 
 
502 aa  256  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  35.85 
 
 
505 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  36.49 
 
 
503 aa  256  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  34.99 
 
 
505 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2050  NADH dehydrogenase subunit M  33.95 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232549  normal  0.0955875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  34.55 
 
 
508 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.93 
 
 
507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  35.2 
 
 
502 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  35.95 
 
 
496 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2553  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.74 
 
 
504 aa  254  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.668765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  34.86 
 
 
502 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1304  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  37.42 
 
 
521 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278041  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.47 
 
 
504 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.54 
 
 
535 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>