296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1700 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  100 
 
 
269 aa  497  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
269 aa  497  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1653  flagellar biosynthetic protein FliR  84.76 
 
 
266 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.314291  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  41.79 
 
 
257 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  34.31 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  40 
 
 
253 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  33.19 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  33.19 
 
 
258 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  35.08 
 
 
259 aa  136  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  38.34 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  34.45 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  38.05 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  36.07 
 
 
267 aa  133  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  36.33 
 
 
265 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  36.33 
 
 
265 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  36.33 
 
 
265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  34.27 
 
 
258 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  33.87 
 
 
258 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  39.71 
 
 
263 aa  132  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  35.51 
 
 
265 aa  132  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  36.09 
 
 
266 aa  131  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  35.96 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  33.47 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  33.47 
 
 
258 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  33.87 
 
 
258 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  35.02 
 
 
262 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  35.51 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  35.06 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  33.74 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  31.3 
 
 
261 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  31.6 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  35.15 
 
 
261 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  33.84 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  33.6 
 
 
259 aa  126  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  34.69 
 
 
265 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  34.69 
 
 
265 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  34.69 
 
 
265 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  36.24 
 
 
236 aa  123  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 
260 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  36.54 
 
 
260 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  34.96 
 
 
265 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  35.44 
 
 
260 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  35 
 
 
259 aa  122  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  34.13 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  35.91 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  28.45 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 
260 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  33.06 
 
 
264 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  31.56 
 
 
261 aa  118  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  35.93 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  36.02 
 
 
266 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  37.75 
 
 
264 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  32.23 
 
 
247 aa  115  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  32.23 
 
 
256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  31.08 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  31.08 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  32.2 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1703  flagellar biosynthesis protein FliR  30.92 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  33.07 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  30.74 
 
 
258 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  34.6 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 
240 aa  112  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04965  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  31.67 
 
 
258 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  33.07 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  32.28 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  33.07 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  33.07 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  32.41 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  29.58 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002827  flagellar biosynthesis protein FliR  29.34 
 
 
260 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  31.97 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  33.97 
 
 
261 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  31.88 
 
 
256 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  30.17 
 
 
260 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  29.84 
 
 
260 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  32.74 
 
 
264 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  35.04 
 
 
260 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  32.72 
 
 
264 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2296  flagellar biosynthesis protein FliR  30.58 
 
 
260 aa  105  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  29.58 
 
 
257 aa  105  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  36.36 
 
 
260 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  32.71 
 
 
256 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  36.46 
 
 
264 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  31.88 
 
 
261 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  33.86 
 
 
260 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  31.71 
 
 
264 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  31.03 
 
 
265 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  28.51 
 
 
257 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  33.19 
 
 
260 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  33.46 
 
 
260 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3389  flagellar biosynthetic protein FliR  28.12 
 
 
260 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  33.19 
 
 
260 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  33.19 
 
 
260 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  30.43 
 
 
255 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  33.19 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  33.19 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  33.19 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  33.19 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>