127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1434 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1434  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 295 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349214 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6216  carbohydrate kinase PfkB family  80.72 
 
 		 304 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1509  ribokinase-like domain-containing protein  80.55 
 
 		 294 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0113854 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1812  ribokinase-like domain-containing protein  55.86 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916129  decreased coverage  0.00793411 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2307  PfkB  53.74 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.013346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1338  PfkB  50 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1547  putative carbohydrate kinase  51.48 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.23954 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  33.56 
 
 		 363 aa  93.6  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  27.41 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  27.04 
 
 		 321 aa  85.9  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  30.34 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  29.33 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  29.7 
 
 		 363 aa  79  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  35.93 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  26.6 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  26.6 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  25.75 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  29.04 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  31.03 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  32.18 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  23.15 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  34.21 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1264  PfkB  36 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  34.3 
 
 		 369 aa  68.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  27.49 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  22.71 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  32.18 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  29.05 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  33.89 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  29.05 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  29.53 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  29.05 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  29.05 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  29.05 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  29.05 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  33.56 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  28.72 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  27.47 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  27.4 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  26.59 
 
 		 382 aa  53.9  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  26.04 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  26.59 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  30.94 
 
 		 295 aa  53.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  26.59 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  26.59 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  26.04 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  26.59 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  26.04 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  25.36 
 
 		 313 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.98 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.98 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  26.64 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  33.57 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.98 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  26.98 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  30 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2884  ribokinase-like domain-containing protein  31.38 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.98 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.98 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  31.36 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  30.34 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00870  sugar kinase, ribokinase  33.09 
 
 		 445 aa  49.3  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.454231  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  27.65 
 
 		 298 aa  49.3  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  30.17 
 
 		 314 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  21.71 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  26.42 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  28.77 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  31.14 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  39.84 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.62 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  30.22 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0148  ribokinase-like domain-containing protein  42.11 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2205  PfkB  30.8 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.503057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  50 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  29.07 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  28.97 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  27.95 
 
 		 326 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  39.29 
 
 		 318 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4286  putative carbohydrate kinase  40.35 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  35.21 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  22.15 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  26.22 
 
 		 647 aa  45.8  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  30.66 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6323  ribokinase family sugar kinase  40 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  28.28 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  37.86 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  20.21 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0423  PfkB domain protein  44 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  45.1 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  30.86 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  26.04 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  28.68 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  29.87 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  23.13 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  26.79 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  29.29 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>