172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1334 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  247  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  98.41 
 
 		 126 aa  244  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  67.52 
 
 		 124 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  39.62 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 559 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.68 
 
 		 847 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  37.84 
 
 		 1096 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0074  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 		 1111 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38 
 
 		 384 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  35.45 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7958  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 1096 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  43.75 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.04 
 
 		 844 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  38.66 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5585  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03021  regulatory protein  33.94 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5600  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  37.76 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0251  hypothetical protein  36.89 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 602 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  36.73 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1001  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283402  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  41.58 
 
 		 856 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1154  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  31.86 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  32.79 
 
 		 847 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.74 
 
 		 384 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  37.76 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.74 
 
 		 384 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  32.77 
 
 		 847 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  33.91 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6170  hypothetical protein  35.05 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1726  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  34 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1262  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 195 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2922  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  35.35 
 
 		 195 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.39 
 
 		 849 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0646  response regulator receiver domain-containing protein  36.7 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  36.73 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  39.6 
 
 		 855 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  32.43 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  34.02 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1555  hypothetical protein  37.86 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36 
 
 		 846 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4411  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  27.43 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0432  hypothetical protein  34.02 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5235  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0801642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  31.25 
 
 		 376 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  33.6 
 
 		 852 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3092  response regulator receiver protein  37.37 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0555687  normal  0.395265 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 631 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5569  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.097054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  34.02 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0073  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3180  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0167969  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2023  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  29.63 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2866  response regulator receiver  37.37 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2738  response regulator receiver domain-containing protein  29.2 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2402  response regulator receiver and unknown domain protein  39.18 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000734485  normal  0.97225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00619  two-component system regulatory protein  39.51 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0604  response regulator receiver protein  33.67 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  32.43 
 
 		 844 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2623  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 792 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2384  response regulator receiver  30.89 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00466139  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  30.93 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  28.12 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  30.84 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  30 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1793  response regulator receiver domain-containing protein  26.55 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3106  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  30.21 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3234  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 207 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0140449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>