41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1240 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  98.64 
 
 		 369 aa  742    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  87.28 
 
 		 393 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  798    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  64.69 
 
 		 395 aa  500  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  58.58 
 
 		 429 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  60.49 
 
 		 395 aa  438  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  51.34 
 
 		 410 aa  381  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  49.74 
 
 		 400 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  45.26 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  45.48 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  45.48 
 
 		 427 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  45.21 
 
 		 422 aa  296  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  43.51 
 
 		 420 aa  293  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  43.42 
 
 		 424 aa  292  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  44.61 
 
 		 367 aa  290  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  44.3 
 
 		 423 aa  289  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  44.25 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  40.91 
 
 		 412 aa  280  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  39.02 
 
 		 400 aa  269  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  36.66 
 
 		 408 aa  268  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  45.5 
 
 		 402 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  40.56 
 
 		 391 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  41.14 
 
 		 397 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  43.3 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  41.46 
 
 		 416 aa  259  7e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  42.3 
 
 		 408 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  41.74 
 
 		 408 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  41.46 
 
 		 408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  38.64 
 
 		 405 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  39.57 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  36.71 
 
 		 402 aa  202  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  37.83 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  39.93 
 
 		 406 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  35.69 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  36.63 
 
 		 393 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  24.55 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  23.77 
 
 		 415 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  22.68 
 
 		 413 aa  53.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  23.05 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  23.64 
 
 		 445 aa  50.4  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  22.29 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>