210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1222 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  98.48 
 
 
329 aa  645    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
329 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  81.37 
 
 
329 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  58.01 
 
 
331 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  55.63 
 
 
330 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  52.38 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  51.7 
 
 
339 aa  288  6e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  50.78 
 
 
336 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  48.29 
 
 
353 aa  256  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  43.63 
 
 
355 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
331 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  31.39 
 
 
341 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  31.48 
 
 
343 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  29.19 
 
 
352 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  34.43 
 
 
340 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  31.29 
 
 
358 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 
368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  31.13 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
333 aa  100  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
352 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 
360 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
389 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.61 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  27.74 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  30.58 
 
 
822 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  20.35 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 
326 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  31.31 
 
 
321 aa  62.4  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
358 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
322 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
244 aa  59.7  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
351 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 
395 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
335 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
260 aa  57.4  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  27.91 
 
 
334 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  25.2 
 
 
1099 aa  56.2  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0808  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.5 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.1 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
1359 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
291 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0704  polyprenyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.5 
 
 
285 aa  55.8  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  27.24 
 
 
1101 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.48 
 
 
1124 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  25.84 
 
 
268 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
330 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 
1120 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
509 aa  52.8  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  39.58 
 
 
296 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 
637 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.33 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  22.88 
 
 
528 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  24.88 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
270 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
327 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27.71 
 
 
283 aa  50.4  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1958  hypothetical protein  54.55 
 
 
229 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
841 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
224 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 
237 aa  50.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
286 aa  49.7  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  25.54 
 
 
303 aa  49.7  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
327 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
314 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
297 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  27.99 
 
 
789 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
297 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  27.99 
 
 
789 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5474  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.11 
 
 
247 aa  49.3  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0224375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  27.99 
 
 
789 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  32.18 
 
 
313 aa  49.3  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 
1002 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
235 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0143  glycosyl transferase family protein  24 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
236 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  28.89 
 
 
245 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  27.14 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2509  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0660  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
234 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0865617 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  21.09 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
717 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  46.94 
 
 
334 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3451  hypothetical protein  26.92 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
477 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>