More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1197 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
264 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0866404 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2538  Short-chain dehydrogenase/reductase  99.23 
 
 
259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1985  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.19 
 
 
261 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.274604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.13 
 
 
259 aa  394  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.560822  normal  0.0105475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.13 
 
 
259 aa  387  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.68 
 
 
259 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0406347 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.77 
 
 
260 aa  371  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.482868  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.5 
 
 
259 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154867  normal  0.0871554 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.69 
 
 
278 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5619  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.98 
 
 
277 aa  288  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0753007  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3257  putative 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  57.71 
 
 
259 aa  284  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.68 
 
 
259 aa  284  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.861645  normal  0.226141 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1017  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  60.08 
 
 
325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.2 
 
 
285 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0641216  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.89 
 
 
259 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336154  normal  0.942948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.89 
 
 
259 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.5 
 
 
259 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.400056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1983  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.2 
 
 
263 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.1 
 
 
259 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.53 
 
 
263 aa  278  7e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.81 
 
 
263 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.86 
 
 
262 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.80685  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2186  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  55.64 
 
 
263 aa  274  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.06 
 
 
260 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1388  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  61.26 
 
 
259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.66 
 
 
260 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1882  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  61.26 
 
 
259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1234  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  61.26 
 
 
259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0789  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  61.26 
 
 
259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0355352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  61.26 
 
 
259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00809972  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1078  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  61.26 
 
 
259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.296983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  61.26 
 
 
259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0730868  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.5 
 
 
259 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736401  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.04 
 
 
264 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.48 
 
 
259 aa  265  8e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1210  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.51 
 
 
260 aa  264  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.475284  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16730  glucose/ribitol dehydrogenase family protein  57.42 
 
 
262 aa  264  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.681173  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.49 
 
 
264 aa  258  8e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857266  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.08 
 
 
258 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.567568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2540  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  55.08 
 
 
258 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.48 
 
 
260 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.78 
 
 
259 aa  255  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.83 
 
 
265 aa  254  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.25 
 
 
260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.285403  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.85 
 
 
276 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.08 
 
 
258 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.298877  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
259 aa  249  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460679  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03629  oxidoreductase  53.17 
 
 
258 aa  246  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.37 
 
 
276 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
259 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000437524  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3053  oxidoreductase  57.87 
 
 
260 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.42458  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3876  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.26 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.91 
 
 
260 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.74 
 
 
238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.49 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.62 
 
 
259 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.930185  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0589  putative short-chain dehydrogenase/reductase  49.22 
 
 
259 aa  218  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398549  normal  0.212573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 
259 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 
259 aa  206  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.49 
 
 
247 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
248 aa  192  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0734499  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
262 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
261 aa  178  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
261 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
261 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
262 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
262 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
237 aa  168  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1391  NAD/NADP dependent oxidoreductase  40.47 
 
 
261 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
263 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
266 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
260 aa  167  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
259 aa  165  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199675 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1821  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
237 aa  163  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
245 aa  161  9e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.35981 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
259 aa  161  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0333473 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
267 aa  159  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
260 aa  159  6e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
261 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
262 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163833  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
263 aa  156  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
261 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 
262 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
262 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
260 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
261 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.199007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
257 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0315057  normal  0.582541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
260 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.389039  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07435  putative short-chain dehydrogenase/reductase  32.56 
 
 
269 aa  149  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.492431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
262 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209308  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
255 aa  145  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336427  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
261 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
261 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
261 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283398  normal  0.300878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>