More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1101 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  99.18 
 
 		 122 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  87.7 
 
 		 122 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  59.17 
 
 		 121 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2842  response regulator receiver domain-containing protein  60 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  60.83 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  59.17 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  59.17 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  61.67 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  58.33 
 
 		 121 aa  147  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3207  response regulator receiver protein  57.38 
 
 		 124 aa  144  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  60 
 
 		 121 aa  143  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  50 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  50 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2707  response regulator receiver protein  59.17 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  48.74 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  47.9 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  50.42 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  51.24 
 
 		 136 aa  120  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  49.58 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  46.96 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3466  response regulator receiver protein  60.17 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.12169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  50 
 
 		 121 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  47.06 
 
 		 128 aa  116  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  47.83 
 
 		 123 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  47.83 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  43.7 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  45.69 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  43.97 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  49.17 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  46.09 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  46.55 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  45.69 
 
 		 121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  46.09 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  43.7 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  43.7 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  44.54 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  44.54 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  46.09 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  47.06 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  44.35 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  41.18 
 
 		 120 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  42.11 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  42.15 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  44.83 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  41.03 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  43.48 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1576  response regulator receiver domain-containing protein  44.35 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0980022  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0164  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  42.37 
 
 		 1888 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3796  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3357  response regulator receiver protein  50.45 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356565  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0181  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 121 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0168  response regulator receiver protein  49.09 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3816  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0255  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>