195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1082 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 317 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  99.05 
 
 		 317 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  79.81 
 
 		 320 aa  481  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  49.32 
 
 		 315 aa  291  7e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  48.85 
 
 		 314 aa  275  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  46.47 
 
 		 320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  43.59 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  36.52 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  36.67 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  37.71 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  37.33 
 
 		 344 aa  155  8e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  37.67 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 		 314 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  36.68 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  37.59 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  36.49 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 329 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  34.6 
 
 		 345 aa  139  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  37.92 
 
 		 333 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 323 aa  129  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  33.11 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  34.57 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  30.07 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  29 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  34.05 
 
 		 324 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  32.35 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  29.15 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 324 aa  112  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  29.69 
 
 		 332 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  32.05 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  31 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  28.53 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  28.96 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  28.23 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  28.41 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  29.74 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 		 324 aa  99.4  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 364 aa  98.6  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 329 aa  96.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  29.56 
 
 		 338 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  29.25 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  29.25 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  29.25 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  29.25 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  29.86 
 
 		 345 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  26.33 
 
 		 638 aa  92.8  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  28.66 
 
 		 330 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  28.97 
 
 		 340 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.308584 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  28.72 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  28.72 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  28.72 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  28.72 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  28.72 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  28.72 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  28.72 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  28.72 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  29.35 
 
 		 331 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  29.77 
 
 		 345 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  30.18 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  30.18 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  28.14 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  28.83 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  30.56 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  30 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  28.95 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  27.51 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  25.46 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  26.2 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.67 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  22.03 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5214  lipase  24.44 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  24.58 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5161  hypothetical protein  23.6 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.382535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5299  hypothetical protein  24.82 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  24.89 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  24.89 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0304  lipase  24.29 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.107873 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>