More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1027 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1027  ABC transporter related  100 
 
 
502 aa  1006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8293  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2366  ABC sugar (ribose) transporter, fused ATPase subunits  99.6 
 
 
502 aa  1000  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  60.28 
 
 
504 aa  624  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5167  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  52.72 
 
 
517 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5973  ABC transporter related  55.28 
 
 
516 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7217  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6460  ABC transporter related  54.53 
 
 
516 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121658  normal  0.108747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2995  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.24 
 
 
522 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2876  ABC transporter  52.14 
 
 
523 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2994  ABC transporter related  50.6 
 
 
512 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2759  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.6 
 
 
512 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43610  ABC transporter  50.71 
 
 
516 aa  481  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00213135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  44.31 
 
 
497 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  39.68 
 
 
496 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  9.97744e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  38.87 
 
 
496 aa  400  1e-110  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 
494 aa  401  1e-110  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 
494 aa  400  1e-110  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 
494 aa  400  1e-110  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 
494 aa  401  1e-110  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 
494 aa  399  1e-110  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 
494 aa  400  1e-110  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2723  ABC transporter related  44.14 
 
 
515 aa  398  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.47 
 
 
494 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.07 
 
 
494 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  41.3 
 
 
494 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  41.09 
 
 
525 aa  383  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  40.33 
 
 
495 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  36.51 
 
 
493 aa  381  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  43.27 
 
 
499 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0667  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.91 
 
 
461 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  39.55 
 
 
500 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  40.21 
 
 
513 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  42.04 
 
 
504 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
508 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  38.97 
 
 
501 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  40 
 
 
511 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  39.44 
 
 
520 aa  366  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  40.28 
 
 
502 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  39.44 
 
 
509 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  39.79 
 
 
513 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 
492 aa  368  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  35.44 
 
 
504 aa  368  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 
525 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3058  ABC transporter related  40.6 
 
 
502 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00083367  normal  0.295827 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  39.21 
 
 
501 aa  368  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  39.72 
 
 
500 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  37.1 
 
 
503 aa  363  4e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.10391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  37.95 
 
 
494 aa  363  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  8.1797e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  37.78 
 
 
492 aa  363  4e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  36.64 
 
 
505 aa  363  5e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  40.97 
 
 
501 aa  363  5e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  39.68 
 
 
505 aa  363  5e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  38.02 
 
 
501 aa  362  8e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  38.34 
 
 
525 aa  362  9e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  40.51 
 
 
504 aa  362  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  38.23 
 
 
499 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  38.23 
 
 
499 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  38.38 
 
 
500 aa  361  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  42.43 
 
 
499 aa  361  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  39.79 
 
 
513 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  39.92 
 
 
503 aa  361  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  39.96 
 
 
506 aa  360  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  39.72 
 
 
511 aa  360  4e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  37.73 
 
 
501 aa  360  4e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  39.72 
 
 
510 aa  360  4e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  40.84 
 
 
503 aa  360  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  37.53 
 
 
497 aa  359  6e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  38.57 
 
 
520 aa  359  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.87 
 
 
527 aa  359  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  39.03 
 
 
494 aa  358  8e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  37.25 
 
 
496 aa  358  1e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.73 
 
 
501 aa  358  2e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  37.83 
 
 
495 aa  357  2e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  39.25 
 
 
524 aa  357  2e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  39.87 
 
 
524 aa  357  2e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  39.25 
 
 
524 aa  357  3e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  39.25 
 
 
524 aa  357  3e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  39.66 
 
 
524 aa  357  4e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  39.64 
 
 
505 aa  356  5e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  40.69 
 
 
511 aa  356  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
523 aa  356  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  39.68 
 
 
504 aa  355  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  40.37 
 
 
501 aa  355  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  40.37 
 
 
501 aa  355  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  40.37 
 
 
501 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  40.37 
 
 
501 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  40.76 
 
 
509 aa  355  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  40.37 
 
 
501 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  36.86 
 
 
507 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1866  D-xylose ABC transporter, ATPase subunit  39.44 
 
 
509 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  38.41 
 
 
495 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  40.37 
 
 
501 aa  355  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  40.7 
 
 
508 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  39.41 
 
 
518 aa  354  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  43.15 
 
 
540 aa  354  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  38.98 
 
 
515 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  39.76 
 
 
511 aa  353  3e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  40.37 
 
 
501 aa  353  3e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  36.18 
 
 
506 aa  353  3e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  4.97905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  41.81 
 
 
508 aa  353  3e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  40.04 
 
 
501 aa  353  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>