More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0824 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
234 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2150  glycosyl transferase  95.71 
 
 
237 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3618  hypothetical protein  62.84 
 
 
240 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
209 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
222 aa  118  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  36.27 
 
 
693 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  37.02 
 
 
222 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1787  family 2 glycosyl transferase  39.42 
 
 
210 aa  99.4  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.350467  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
228 aa  98.6  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1959  glycosyl transferase family 2  37.62 
 
 
212 aa  98.2  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.597827  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0298  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00219104  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
226 aa  86.3  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0136  dolichyl-phosphate mannose synthase  36.84 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1685  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.908588  hitchhiker  0.00379696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.98 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  41.44 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  37.59 
 
 
235 aa  79  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000675814  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  37.59 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  41.72 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01630  glycosyl transferase  45.08 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.76765 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  39.53 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  44.74 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  45.87 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0260  glycosyl transferase family 2  41.8 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.306809  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  36.09 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3189  glycosyl transferase family 2  42.98 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  41.23 
 
 
344 aa  68.9  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 
305 aa  68.6  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1577  glycosyl transferase family 2  37.11 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0593  glycosyl transferase family protein  51.47 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  35.95 
 
 
1099 aa  66.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13662  glycosyltransferase  37.29 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0122731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0170  glycosyl transferase family 2  44.26 
 
 
250 aa  65.1  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.121302  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  40.48 
 
 
291 aa  65.1  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  46.59 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  30.56 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  28 
 
 
333 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  34.35 
 
 
321 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  48.89 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
229 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  35.14 
 
 
305 aa  62.8  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
227 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  40.54 
 
 
314 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  47.83 
 
 
380 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  38.52 
 
 
337 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  39.5 
 
 
253 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
229 aa  62.4  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
336 aa  62.4  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 
321 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
228 aa  62  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  38.95 
 
 
310 aa  62  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  50.55 
 
 
245 aa  62  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
228 aa  62  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  30.52 
 
 
461 aa  62  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2284  glycosyl transferase family protein  41.38 
 
 
334 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.911482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0034  family 2 glycosyl transferase  36.79 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
321 aa  61.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  39.8 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  32.48 
 
 
332 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  38.6 
 
 
342 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  38.05 
 
 
307 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 
331 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  39.82 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  39.82 
 
 
312 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
357 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1526  glycosyl transferase family 2  38.78 
 
 
334 aa  60.1  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  44.57 
 
 
320 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0375  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 
337 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.293513 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  41.8 
 
 
252 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  37.11 
 
 
299 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  37.93 
 
 
260 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  33.06 
 
 
328 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
304 aa  59.3  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  37.84 
 
 
310 aa  59.3  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  39.81 
 
 
752 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
227 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
320 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  36.28 
 
 
343 aa  58.9  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  42.74 
 
 
228 aa  58.9  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  45.13 
 
 
242 aa  58.9  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
334 aa  58.5  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  40.62 
 
 
339 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0559  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.79 
 
 
515 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0033  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.04 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0326174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1178  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 
347 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.313377  normal  0.977932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  38.94 
 
 
352 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
305 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  39.08 
 
 
328 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>