194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0733 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  99.45 
 
 		 363 aa  702    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  100 
 
 		 363 aa  705    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  34.56 
 
 		 387 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  24.38 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  38.78 
 
 		 226 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  25.94 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  37.11 
 
 		 226 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  41.24 
 
 		 228 aa  126  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  44.15 
 
 		 226 aa  126  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  43.48 
 
 		 195 aa  123  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  43.39 
 
 		 187 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  36.67 
 
 		 265 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0599  cytochrome B561  36.1 
 
 		 221 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  39.46 
 
 		 182 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  35.39 
 
 		 229 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  40.85 
 
 		 203 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  37.04 
 
 		 228 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  39.78 
 
 		 198 aa  109  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  37.85 
 
 		 214 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  35.6 
 
 		 222 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1811  cytochrome B561  42.71 
 
 		 184 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  38.55 
 
 		 160 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  41.27 
 
 		 204 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  35.36 
 
 		 202 aa  106  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2813  hypothetical protein  42.07 
 
 		 153 aa  106  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  39.15 
 
 		 198 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  38.3 
 
 		 198 aa  105  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  44.79 
 
 		 190 aa  105  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  34.43 
 
 		 231 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1896  cytochrome b561 family protein  39.9 
 
 		 181 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.832729  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  44.79 
 
 		 190 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  40.21 
 
 		 192 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  38.6 
 
 		 236 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  39.47 
 
 		 198 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  35.43 
 
 		 168 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  38.3 
 
 		 210 aa  103  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  38.59 
 
 		 179 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  36.15 
 
 		 222 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0241  diheme cytochrome c  36.25 
 
 		 187 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0241  diheme cytochrome c  36.25 
 
 		 187 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  34.15 
 
 		 237 aa  101  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  39.38 
 
 		 195 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  36.82 
 
 		 219 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  39.38 
 
 		 195 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  39.38 
 
 		 195 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  40.48 
 
 		 173 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  39.38 
 
 		 195 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  36.97 
 
 		 245 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0326  cytochrome B561  37.43 
 
 		 227 aa  99.8  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  38.86 
 
 		 195 aa  99.8  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  37.08 
 
 		 231 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0137  diheme cytochrome c  39.13 
 
 		 177 aa  99  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510343  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3536  cytochrome B561  37.7 
 
 		 219 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0244  diheme cytochrome c  35 
 
 		 183 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3509  cytochrome B561  37.84 
 
 		 181 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  32.64 
 
 		 212 aa  98.2  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0247  diheme cytochrome c  34.38 
 
 		 183 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  29.58 
 
 		 221 aa  97.4  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0316  cytochrome B561  41.18 
 
 		 191 aa  97.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  37.89 
 
 		 199 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  37.89 
 
 		 199 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  37.37 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  35.55 
 
 		 229 aa  96.3  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1924  diheme cytochrome c  38.96 
 
 		 163 aa  96.3  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  36.13 
 
 		 241 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  35.71 
 
 		 191 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  33.65 
 
 		 218 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  44.53 
 
 		 161 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  44.53 
 
 		 170 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2807  putative cytochrome b  43.24 
 
 		 212 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  35.83 
 
 		 184 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  37.63 
 
 		 245 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  41.15 
 
 		 181 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0359  diheme cytochrome c  33.75 
 
 		 187 aa  94  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0590  cytochrome B561  41.94 
 
 		 266 aa  93.6  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1491  cytochrome B561  43.24 
 
 		 182 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.268011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  36.72 
 
 		 160 aa  92.8  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  34.09 
 
 		 188 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0242  diheme cytochrome c  36.8 
 
 		 187 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  36.8 
 
 		 187 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49100  Nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  39.89 
 
 		 232 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1227  cytochrome B561  36.87 
 
 		 175 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4485  diheme cytochrome c  36.8 
 
 		 187 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  37.44 
 
 		 243 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0243  diheme cytochrome c  36.8 
 
 		 187 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1211  cytochrome B561  41.05 
 
 		 178 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  32.04 
 
 		 202 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  33.51 
 
 		 230 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2354  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  39.56 
 
 		 175 aa  89.7  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  38.71 
 
 		 200 aa  90.1  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  30.27 
 
 		 222 aa  89.7  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1765  diheme cytochrome c  35.51 
 
 		 129 aa  89.7  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.230573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  33.51 
 
 		 230 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  33.51 
 
 		 230 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2690  cytochrome B561  37.04 
 
 		 221 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  33.51 
 
 		 230 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  35.68 
 
 		 177 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  31.78 
 
 		 230 aa  87.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10120  cytochrome b561 family protein  39.66 
 
 		 175 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1074  cytochrome B561  39.2 
 
 		 231 aa  87  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0236841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>