More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0643 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  100 
 
 		 282 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  58.42 
 
 		 287 aa  292  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  58.15 
 
 		 280 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  58.15 
 
 		 280 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  62.03 
 
 		 279 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  61.65 
 
 		 279 aa  275  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  53.74 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  53.51 
 
 		 280 aa  258  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  55.6 
 
 		 284 aa  249  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  56.03 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  50.19 
 
 		 280 aa  232  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  49.45 
 
 		 280 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  50.2 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  51.57 
 
 		 284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  37.44 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  36.51 
 
 		 651 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  37.14 
 
 		 1156 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  36.51 
 
 		 651 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  38.26 
 
 		 652 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  37.21 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  42.39 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  42.25 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  47.01 
 
 		 244 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  34.98 
 
 		 668 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  34.82 
 
 		 671 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  34.98 
 
 		 640 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  43.97 
 
 		 620 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  37.11 
 
 		 684 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  37.11 
 
 		 684 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  40.91 
 
 		 669 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  44.83 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  41.18 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  41.18 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  38.15 
 
 		 216 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  43.67 
 
 		 227 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  36.08 
 
 		 683 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  39.88 
 
 		 689 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  42.54 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  39.63 
 
 		 242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  39.77 
 
 		 237 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  43.48 
 
 		 688 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  37.84 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  34.13 
 
 		 230 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  38.32 
 
 		 179 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  39.75 
 
 		 674 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  41.09 
 
 		 243 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  40.68 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  33.15 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  34.78 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  34.81 
 
 		 667 aa  102  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  41.29 
 
 		 345 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  42.86 
 
 		 197 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  36.31 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  35.06 
 
 		 656 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  31.91 
 
 		 251 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  31.91 
 
 		 251 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  39.64 
 
 		 564 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  37.57 
 
 		 381 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  31.15 
 
 		 234 aa  99.4  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  28.92 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  29.72 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  40.49 
 
 		 387 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  39.76 
 
 		 641 aa  95.9  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  33.33 
 
 		 248 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  34.97 
 
 		 247 aa  95.5  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  37.42 
 
 		 365 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  33.33 
 
 		 383 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  36.64 
 
 		 229 aa  90.5  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  38.1 
 
 		 684 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  37.99 
 
 		 245 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  37.99 
 
 		 245 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  40.37 
 
 		 400 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  34.95 
 
 		 223 aa  86.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  37.89 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  35.44 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3465  hypothetical protein  46.27 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0396  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  34.31 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  30.88 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1440  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.44 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.53484  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_002620  TC0715  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.1 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0292  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.54 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09641  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.54 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.486621  normal  0.137034 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15461  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.27 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.614772 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1051  Endopeptidase Clp  27.4 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0321666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  31.25 
 
 		 211 aa  62  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08441  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.14 
 
 		 196 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0799239  hitchhiker  0.00187741 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2037  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  30.82 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.19 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.19513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0750  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.41 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1837  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  32.35 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1059  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.78 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  30.72 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3055  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.71 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2151  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.57 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  31.14 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1247  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.27 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0389  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.94 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000773088  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4545  endopeptidase Clp  32.41 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843015  normal  0.610335 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  29.63 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1554  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.21 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.242253  normal  0.191867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>