More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0571 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0571  pyridoxal kinase  100 
 
 
289 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.36943  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1920  pyridoxal kinase  97.42 
 
 
271 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1437  pyridoxal kinase  90.78 
 
 
282 aa  508  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.469194  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4457  pyridoxal kinase  69.68 
 
 
278 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2302  pyridoxal kinase  45.42 
 
 
288 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1145  pyridoxal kinase  44.29 
 
 
283 aa  226  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4141  pyridoxal kinase  44.57 
 
 
287 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0393  pyridoxal kinase  47.17 
 
 
287 aa  215  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3138  pyridoxal kinase  43.35 
 
 
288 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37680  Pyridoxal kinase  46.22 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1604  pyridoxal kinase  45.42 
 
 
302 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217643  normal  0.871979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1325  pyridoxamine kinase  42.86 
 
 
282 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293127  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0114  pyridoxal kinase  36.78 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2647  pyridoxamine kinase  42.29 
 
 
283 aa  165  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0468114  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01187  pyridoxal kinase  44.34 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0980044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4006  pyridoxamine kinase  42.29 
 
 
293 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2472  pyridoxamine kinase  40.53 
 
 
283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11568  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0612  pyridoxamine kinase  40.83 
 
 
290 aa  155  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2218  pyridoxal kinase  39.38 
 
 
283 aa  155  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0357681  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1345  pyridoxal kinase  39.2 
 
 
313 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.019465  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0144  pyridoxamine kinase  41.63 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2671  pyridoxal kinase  36.33 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.122398  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2946  pyridoxal kinase  35.74 
 
 
278 aa  153  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0674274  normal  0.386186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02318  pyridoxine kinase  33.33 
 
 
283 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1243  pyridoxal kinase  33.33 
 
 
283 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000355778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1260  pyridoxal kinase  33.33 
 
 
283 aa  152  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0966225  hitchhiker  0.000310678 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02279  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0311304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2705  pyridoxal kinase  33.33 
 
 
283 aa  152  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.176712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2553  pyridoxal kinase  33.33 
 
 
283 aa  152  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000166037  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1429  pyridoxamine kinase  40.81 
 
 
282 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2695  pyridoxal kinase  35.96 
 
 
288 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2580  pyridoxal kinase  35.96 
 
 
288 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0656923  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2629  pyridoxal kinase  35.96 
 
 
288 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00675683  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4075  pyridoxamine kinase  39.38 
 
 
283 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.122444  normal  0.8127 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2801  pyridoxal kinase  35.96 
 
 
288 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0705893  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04836  pyridoxine kinase  40.68 
 
 
289 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001095  pyridoxal kinase  39.57 
 
 
289 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2791  pyridoxal kinase  32.95 
 
 
283 aa  150  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2897  pyridoxamine kinase  41.33 
 
 
283 aa  149  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2574  pyridoxal kinase  32.95 
 
 
283 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.303723  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2507  pyridoxal kinase  38.49 
 
 
293 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3649  pyridoxal kinase  33.33 
 
 
283 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00538492  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1147  pyridoxamine kinase  42.15 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4114  pyridoxal kinase  35.48 
 
 
288 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1059  pyridoxamine kinase  39.19 
 
 
282 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.976691  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3224  pyridoxamine kinase  38.95 
 
 
300 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2670  pyridoxamine kinase  41.33 
 
 
283 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8828  predicted protein  37.12 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5353  pyridoxal kinase  46.98 
 
 
290 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2792  pyridoxamine kinase  40.44 
 
 
283 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.783971 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2566  pyridoxal kinase  33.58 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5135  pyridoxamine kinase  34.52 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.358825 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1560  pyridoxamine kinase  35.34 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.706911  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1728  pyridoxamine kinase  34.57 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1547  pyridoxamine kinase  35.34 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.473555  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1695  pyridoxamine kinase  34.69 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1812  pyridoxamine kinase  35.74 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000723622  decreased coverage  0.000302478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5521  pyridoxal kinase  35.36 
 
 
288 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4211  phosphomethylpyrimidine kinase type-1  35.46 
 
 
286 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0105657  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5650  pyridoxamine kinase  35.11 
 
 
290 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0164755 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1761  pyridoxamine kinase  36.6 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.389876  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1724  pyridoxamine kinase  34.94 
 
 
286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000809098  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1620  pyridoxamine kinase  34.94 
 
 
286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.122629  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_004310  BR1830  pyridoxamine kinase  36.6 
 
 
298 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1072  pyridoxamine kinase  36.6 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1541  pyridoxal kinase  38.96 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72780  pyridoxamine kinase  35.34 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5406  pyridoxamine kinase  33.69 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2220  pyridoxamine kinase  32.96 
 
 
286 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4637  pyridoxal kinase  34.84 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5357  pyridoxamine kinase  33.69 
 
 
290 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.968205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5265  pyridoxamine kinase  33.69 
 
 
290 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6318  pyridoxamine kinase  33.69 
 
 
288 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5070  pyridoxamine kinase  35.71 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1199  pyridoxal kinase  39.11 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4336  pyridoxal kinase  36.82 
 
 
303 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.122448 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0933  pyridoxamine kinase  34.39 
 
 
286 aa  127  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213613  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1882  pyridoxamine kinase  33.09 
 
 
286 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2881  pyridoxal kinase  38.67 
 
 
298 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.58504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1774  pyridoxamine kinase  32.6 
 
 
286 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3912  pyridoxamine kinase  37.87 
 
 
291 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0768899 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2660  pyridoxamine kinase  35.48 
 
 
286 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4236  pyridoxamine kinase  36.53 
 
 
291 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2936  pyridoxal kinase  37.23 
 
 
288 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3913  pyridoxal kinase  34.71 
 
 
287 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01606  pyridoxine kinase  34.01 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.285495  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2004  pyridoxal kinase  34.01 
 
 
286 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00305997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1993  pyridoxamine kinase  34.01 
 
 
286 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0266148 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1846  pyridoxamine kinase  34.01 
 
 
286 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000179286  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2490  pyridoxamine kinase  32.98 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01596  hypothetical protein  34.01 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.262345  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1712  pyridoxamine kinase  34.01 
 
 
286 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0772726  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2376  pyridoxamine kinase  35.08 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2348  pyridoxamine kinase  34.01 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.205502  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1563  pyridoxamine kinase  34.01 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3186  pyridoxamine kinase  35.45 
 
 
293 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04250  bud site selection-related protein, putative  40.33 
 
 
402 aa  119  7.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203655  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4367  pyridoxamine kinase  41.67 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1799  pyridoxal kinase  35.47 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803256  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4279  pyridoxal kinase  34.06 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>