126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0558 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  99.64 
 
 		 274 aa  550  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0558  putative Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 274 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0309  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  86.87 
 
 		 274 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  56.94 
 
 		 287 aa  302  5.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1130  SAF domain protein  51.5 
 
 		 280 aa  241  7.999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  49.82 
 
 		 274 aa  238  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  34.63 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  34.08 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  30.96 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  30.08 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  29.38 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  30.08 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  29.41 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  28.29 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  28.29 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  28.29 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  28.57 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  29.11 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  29.11 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  28.82 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  28.15 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  30.41 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  32.31 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  32.31 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  32.31 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  34.34 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  29.31 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  26.69 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  28.11 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  31.44 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  29.18 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  26.72 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  27.01 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  28.02 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  32.49 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  29.03 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  28.81 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  26.85 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  28.73 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  32.04 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  29.28 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  26.98 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  24.79 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  25.83 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  33.72 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  27.06 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  26.02 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  26.94 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  29.49 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  27.92 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  28.57 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  29.29 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  26.36 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  29.44 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  27.98 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  28.95 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  27.73 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  28.51 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  39.09 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  28.51 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  27.52 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  34.17 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  29.17 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  29.53 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  26.75 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  25.79 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  28.12 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  31.98 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  28.82 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  30.21 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  25.24 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  30.43 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  30.43 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  26.15 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  29.47 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  29.38 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0795  Flp pilus assembly protein CpaB  30.43 
 
 		 390 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  26.83 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 		 339 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  29.8 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0553  Flp pilus assembly protein CpaB  36.79 
 
 		 306 aa  52.4  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.853568 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  28.26 
 
 		 274 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  29.79 
 
 		 271 aa  52  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  25.78 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  26.7 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  28.39 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3193  SAF domain-containing protein  30.6 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  32.56 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  28.43 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  28.43 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  28.43 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  29.47 
 
 		 316 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  24.15 
 
 		 298 aa  49.3  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  32.56 
 
 		 317 aa  48.9  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.11 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1884  putative pilus assembly protein CpaB  31.88 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222645  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  27.55 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1681  Flp pilus assembly protein CpaB  31.88 
 
 		 350 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0337  Flp pilus assembly CpaB  31.88 
 
 		 350 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.720767  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1872  putative pilus assembly protein CpaB  31.88 
 
 		 350 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>