217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0502 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  100 
 
 
482 aa  944  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  100 
 
 
482 aa  944  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  48.86 
 
 
482 aa  467  1e-130  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  47.82 
 
 
482 aa  461  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  51.24 
 
 
484 aa  458  1e-128  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  51.24 
 
 
484 aa  459  1e-128  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  51.35 
 
 
484 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  46.89 
 
 
482 aa  450  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  44.91 
 
 
482 aa  433  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  36.02 
 
 
481 aa  320  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  36.44 
 
 
480 aa  313  3e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  39.67 
 
 
490 aa  314  3e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  4.55151e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  37.4 
 
 
480 aa  313  5e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  1.65872e-06 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  36.02 
 
 
481 aa  313  6e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  37.19 
 
 
480 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  35.4 
 
 
481 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  37.4 
 
 
480 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  39.09 
 
 
498 aa  310  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  36.98 
 
 
480 aa  310  5e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  37.42 
 
 
483 aa  309  7e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  35.74 
 
 
480 aa  309  7e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  36.36 
 
 
480 aa  306  4e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  36.98 
 
 
480 aa  306  7e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  37.37 
 
 
484 aa  305  2e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  38.05 
 
 
485 aa  303  4e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  36.57 
 
 
480 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  36.57 
 
 
480 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  36.57 
 
 
480 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  36.57 
 
 
480 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.04543e-06 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  37.5 
 
 
484 aa  299  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  33.33 
 
 
484 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  35.48 
 
 
484 aa  296  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  33.78 
 
 
484 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  33.19 
 
 
484 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  2.85199e-10 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  33.83 
 
 
484 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  39.35 
 
 
498 aa  293  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  42.31 
 
 
493 aa  293  6e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  35.06 
 
 
484 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  35.26 
 
 
480 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  35.28 
 
 
484 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  34.12 
 
 
484 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  33.78 
 
 
484 aa  290  5e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  35.91 
 
 
484 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  37.97 
 
 
481 aa  289  7e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  33.9 
 
 
484 aa  289  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  36.4 
 
 
483 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  38.81 
 
 
472 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  34.5 
 
 
480 aa  286  6e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  35.91 
 
 
484 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  35.8 
 
 
480 aa  280  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  36.02 
 
 
510 aa  272  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  33.61 
 
 
481 aa  266  5e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  34.1 
 
 
482 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  34.05 
 
 
466 aa  257  4e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  33.48 
 
 
500 aa  254  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  32.69 
 
 
466 aa  253  4e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  33.75 
 
 
484 aa  253  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  33.81 
 
 
483 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  33.33 
 
 
485 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  33.2 
 
 
483 aa  246  6e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  34.29 
 
 
488 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  31.87 
 
 
466 aa  242  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  36.91 
 
 
484 aa  239  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  33.89 
 
 
482 aa  236  5e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  34.42 
 
 
484 aa  234  4e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  34.36 
 
 
483 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  33.89 
 
 
482 aa  229  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  7.33585e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  31.11 
 
 
491 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  33.54 
 
 
485 aa  226  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  32.8 
 
 
494 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  33.27 
 
 
485 aa  224  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  34.61 
 
 
485 aa  223  5e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  3.66479e-08 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  34.61 
 
 
485 aa  223  5e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.91681e-06  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  33.61 
 
 
483 aa  223  5e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001986  potassium uptake protein TrkH  34.08 
 
 
485 aa  223  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  33.2 
 
 
498 aa  223  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  34.39 
 
 
485 aa  222  1e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  32.92 
 
 
485 aa  222  1e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  34.39 
 
 
485 aa  222  1e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  34.39 
 
 
485 aa  222  1e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  34.39 
 
 
485 aa  222  1e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.99675e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  34.39 
 
 
485 aa  222  1e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  32.86 
 
 
485 aa  221  2e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  34.18 
 
 
485 aa  221  2e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  30.57 
 
 
485 aa  221  2e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  33.67 
 
 
481 aa  219  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  32.45 
 
 
485 aa  219  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.77354e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  33.47 
 
 
485 aa  217  3e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  33.2 
 
 
483 aa  218  3e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  32.55 
 
 
486 aa  217  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  33.33 
 
 
483 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  33.54 
 
 
483 aa  216  6e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  32.98 
 
 
488 aa  216  6e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  32.93 
 
 
485 aa  216  8e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  32.51 
 
 
483 aa  215  2e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00462  potassium uptake protein TrkH  32.99 
 
 
485 aa  214  2e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  33.54 
 
 
483 aa  214  3e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  30.27 
 
 
481 aa  214  4e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  34.15 
 
 
483 aa  213  5e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  34.15 
 
 
483 aa  213  5e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>