More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0444 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 554 aa  1101    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 554 aa  1101    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  66.25 
 
 		 556 aa  741    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  66.37 
 
 		 554 aa  742    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  69.37 
 
 		 554 aa  765    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  92.78 
 
 		 554 aa  1037    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  65.59 
 
 		 554 aa  747    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  50.45 
 
 		 535 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  49.29 
 
 		 532 aa  484  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  48.48 
 
 		 533 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  48.58 
 
 		 534 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  47.71 
 
 		 533 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  47.32 
 
 		 533 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  47.77 
 
 		 533 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  48.66 
 
 		 533 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.48 
 
 		 856 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.92 
 
 		 856 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  45.18 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  45.42 
 
 		 534 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  44.42 
 
 		 532 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  44.62 
 
 		 531 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  43.44 
 
 		 534 aa  415  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  45.96 
 
 		 533 aa  415  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.81 
 
 		 853 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  47.08 
 
 		 849 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  45.89 
 
 		 532 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  42.58 
 
 		 532 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  42.58 
 
 		 532 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  41.99 
 
 		 531 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  43.16 
 
 		 534 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.25 
 
 		 848 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  42.13 
 
 		 551 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  44.04 
 
 		 537 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  47.41 
 
 		 839 aa  395  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.6 
 
 		 844 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.44 
 
 		 845 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.26 
 
 		 844 aa  385  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  40.71 
 
 		 535 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  40.32 
 
 		 525 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.19 
 
 		 844 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.06 
 
 		 834 aa  360  3e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  42.66 
 
 		 533 aa  353  5e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  37.83 
 
 		 843 aa  353  5.9999999999999994e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  36.85 
 
 		 501 aa  352  7e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  41.95 
 
 		 530 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  37.6 
 
 		 594 aa  346  6e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  37.6 
 
 		 594 aa  346  6e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  39.29 
 
 		 532 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.32 
 
 		 846 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  40.52 
 
 		 532 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  36.88 
 
 		 508 aa  342  9e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  36.33 
 
 		 505 aa  342  1e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  39.84 
 
 		 530 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  39.03 
 
 		 533 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.97 
 
 		 846 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  39.64 
 
 		 532 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  36.85 
 
 		 632 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  41.09 
 
 		 532 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  40.4 
 
 		 531 aa  337  5e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  36.69 
 
 		 632 aa  335  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  41.26 
 
 		 529 aa  334  3e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  40.87 
 
 		 533 aa  333  5e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  35.97 
 
 		 632 aa  332  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  41.7 
 
 		 524 aa  330  4e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  39.76 
 
 		 530 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  35.37 
 
 		 625 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  41.72 
 
 		 533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  40.91 
 
 		 526 aa  326  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  39.88 
 
 		 533 aa  326  9e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  35.75 
 
 		 621 aa  326  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2191  preprotein translocase subunit SecD  36.54 
 
 		 616 aa  325  9e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111681  decreased coverage  0.00360319 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  38.98 
 
 		 521 aa  325  1e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  38.94 
 
 		 614 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  37.64 
 
 		 526 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0627  protein-export membrane protein SecD  46.47 
 
 		 502 aa  322  9.999999999999999e-87  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57035  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  37.57 
 
 		 534 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2880  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 616 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000488716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2785  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 616 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000401853  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2805  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 616 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000153559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  38.69 
 
 		 533 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  35.61 
 
 		 640 aa  320  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1403  preprotein translocase subunit SecD  35.28 
 
 		 616 aa  320  6e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00249908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  38.45 
 
 		 615 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2212  protein-export membrane protein SecD  36.94 
 
 		 620 aa  318  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363799  normal  0.0593357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1572  preprotein translocase subunit SecD  35.4 
 
 		 616 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000232578  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  38.41 
 
 		 521 aa  318  2e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1437  preprotein translocase subunit SecD  35.44 
 
 		 616 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013441  hitchhiker  0.000143717 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00522  preprotein translocase subunit SecD  35.41 
 
 		 614 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1292  preprotein translocase subunit SecD  35.29 
 
 		 620 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1449  preprotein translocase subunit SecD  35.44 
 
 		 616 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00202636  normal  0.0146122 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1407  secretion protein SecD  34.64 
 
 		 622 aa  317  4e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0970542  normal  0.495357 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  40.41 
 
 		 526 aa  317  4e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14630  preprotein translocase subunit SecD  35.29 
 
 		 620 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  37.5 
 
 		 522 aa  316  8e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0941  preprotein translocase subunit SecD  34.86 
 
 		 625 aa  316  8e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2527  preprotein translocase subunit SecD  40.08 
 
 		 681 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1977  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 618 aa  314  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3111  preprotein translocase subunit SecD  35.76 
 
 		 616 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1384  preprotein translocase subunit SecD  35.28 
 
 		 616 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000494152  hitchhiker  0.000000727457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  39.84 
 
 		 636 aa  313  4.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>