More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0440 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
204 aa  414  1e-115  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  99.02 
 
 
204 aa  410  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  84.8 
 
 
204 aa  355  3e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  61.58 
 
 
215 aa  215  3e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  58.33 
 
 
202 aa  215  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  62.18 
 
 
189 aa  196  2e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  58.24 
 
 
191 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  40.57 
 
 
191 aa  120  1e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  55.17 
 
 
362 aa  119  2e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  55.05 
 
 
280 aa  120  2e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
211 aa  117  1e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  41.11 
 
 
362 aa  116  2e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  55.26 
 
 
212 aa  116  2e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  51.72 
 
 
368 aa  115  4e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3638  lytic transglycosylase catalytic  58.76 
 
 
206 aa  115  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  55.14 
 
 
280 aa  114  9e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.67564e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  55.56 
 
 
206 aa  114  1e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  51.28 
 
 
283 aa  114  1e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3973  lytic transglycosylase catalytic  58.76 
 
 
204 aa  113  2e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  50.79 
 
 
206 aa  113  2e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  53.1 
 
 
235 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4176  lytic transglycosylase, catalytic  57.94 
 
 
354 aa  111  7e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  53.64 
 
 
291 aa  111  8e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  52.63 
 
 
198 aa  110  1e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  4.27479e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  51.72 
 
 
174 aa  110  1e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  40.12 
 
 
204 aa  110  2e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  51.4 
 
 
318 aa  110  2e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  50.44 
 
 
197 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  49.19 
 
 
222 aa  108  4e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  40.12 
 
 
204 aa  108  4e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  40.65 
 
 
203 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  5.18233e-15  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  44.29 
 
 
189 aa  107  9e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  46.79 
 
 
200 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  50.44 
 
 
228 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  56.31 
 
 
199 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  48.21 
 
 
325 aa  105  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3822  lytic transglycosylase, catalytic  53.61 
 
 
204 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.539253  normal  0.0346403 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  48.8 
 
 
261 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  50.91 
 
 
244 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  48.33 
 
 
243 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  50.85 
 
 
217 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  44.35 
 
 
202 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  51.33 
 
 
202 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0527  Lytic transglycosylase catalytic  45.6 
 
 
155 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.193488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  56.36 
 
 
271 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  46.4 
 
 
154 aa  102  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  56.36 
 
 
278 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  43.97 
 
 
438 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  49.54 
 
 
196 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  46.49 
 
 
242 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  48.15 
 
 
245 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  42.42 
 
 
370 aa  100  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2518  lytic transglycosylase catalytic  47.41 
 
 
224 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  52.25 
 
 
327 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  51.43 
 
 
194 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  43.09 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  52.63 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  50.49 
 
 
442 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.329237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  46.55 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  46.55 
 
 
197 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  47.54 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  47.5 
 
 
299 aa  99  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  44.88 
 
 
226 aa  99  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  49.11 
 
 
234 aa  98.6  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  34.48 
 
 
247 aa  97.8  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  47.54 
 
 
285 aa  97.8  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  42.75 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  42.75 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  41.88 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  43.48 
 
 
158 aa  96.7  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  45 
 
 
329 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4561  lytic transglycosylase catalytic  57.27 
 
 
360 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000593543  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  42.25 
 
 
297 aa  96.3  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  48.31 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  42.25 
 
 
297 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  52.83 
 
 
194 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  46.85 
 
 
217 aa  95.9  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  42.03 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  46.61 
 
 
203 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  47.79 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  52.88 
 
 
201 aa  95.5  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  45.69 
 
 
304 aa  95.1  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  48.72 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  47.75 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  43.9 
 
 
281 aa  94  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  43.51 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  45.76 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  45.08 
 
 
296 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  45.08 
 
 
296 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  46.85 
 
 
195 aa  93.2  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  43.64 
 
 
305 aa  92.8  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  42.73 
 
 
273 aa  92.4  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  42.24 
 
 
328 aa  91.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 
216 aa  91.7  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  46.15 
 
 
245 aa  92  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  34.94 
 
 
259 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  5.72163e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  46.9 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2441  lytic transglycosylase, catalytic  43.59 
 
 
300 aa  90.5  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0168706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>