More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0372 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
101 aa  200  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
101 aa  200  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  95.05 
 
 
101 aa  196  1e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  82.18 
 
 
101 aa  168  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  74.26 
 
 
101 aa  156  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  75.25 
 
 
101 aa  153  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  75.25 
 
 
101 aa  152  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 
104 aa  121  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 
104 aa  119  2e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
104 aa  116  1e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 
104 aa  115  2e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 
104 aa  115  2e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 
105 aa  114  4e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  57.58 
 
 
103 aa  114  4e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  56.12 
 
 
102 aa  112  1e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  56.57 
 
 
103 aa  111  4e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  57.58 
 
 
103 aa  111  4e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  55.56 
 
 
103 aa  110  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 
105 aa  110  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  56 
 
 
104 aa  109  1e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  55.1 
 
 
102 aa  109  1e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  55.1 
 
 
102 aa  109  1e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 
105 aa  107  7e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  54.55 
 
 
104 aa  107  8e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  52.53 
 
 
104 aa  106  9e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 
105 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  7.60345e-07  unclonable  2.81859e-10 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2828  50S ribosomal protein L24  54 
 
 
102 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000539429  normal  0.361907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  56.73 
 
 
106 aa  104  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  52.43 
 
 
105 aa  103  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  52.53 
 
 
104 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  51.52 
 
 
104 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 
104 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  5.85684e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  51.52 
 
 
104 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  57.84 
 
 
104 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 
106 aa  100  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0325  50S ribosomal protein L24  51.55 
 
 
102 aa  99.4  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000177904  decreased coverage  0.0025148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  47.47 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3633  50S ribosomal protein L24  52.58 
 
 
102 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  4.32444e-06  decreased coverage  1.35878e-12 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  49.02 
 
 
118 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 
104 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  98.6  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.08454e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  98.6  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  59.22 
 
 
105 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  53.77 
 
 
106 aa  98.2  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  52.53 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 
106 aa  97.8  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  48.08 
 
 
104 aa  97.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3168  50S ribosomal protein L24  52 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  4.00105e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3306  50S ribosomal protein L24  53 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  1.4944e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0260  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0016412  hitchhiker  0.00832042 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2939  50S ribosomal protein L24  53.61 
 
 
102 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  6.8942e-08  hitchhiker  3.99132e-06 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3286  50S ribosomal protein L24  53.61 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  7.51448e-10  decreased coverage  5.09284e-07 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 
105 aa  94.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1935  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
102 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000142192  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0061  50S ribosomal protein L24  51.55 
 
 
102 aa  94  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  7.62997e-10  hitchhiker  1.34485e-17 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3158  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
102 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  5.69435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0064  50S ribosomal protein L24  50.52 
 
 
102 aa  94  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  6.43332e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3489  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
102 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00124411  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3735  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
102 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  1.53975e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3057  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
102 aa  94  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  2.84312e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3793  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
102 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3765  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
102 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000275135  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2621  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
102 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.199386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 
103 aa  94  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.36575e-10  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 
103 aa  94  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.09018e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 
103 aa  94  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.77787e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 
103 aa  94  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.27512e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 
103 aa  94  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.11062e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 
103 aa  94  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 
103 aa  94  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.07051e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 
103 aa  94  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  6.03774e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 
103 aa  94  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  5.45325e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0338  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
102 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000146987  normal  0.0110732 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3458  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
102 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  5.15991e-08  decreased coverage  0.00425299 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2748  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
102 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  2.11604e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0278  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
102 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  6.98437e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0359  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
102 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  3.04489e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0287  50S ribosomal protein L24  51 
 
 
102 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  2.08318e-07  normal  0.0220043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0169  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.84148e-07  hitchhiker  0.000323291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0181  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.29578e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.83187e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3008  50S ribosomal protein L24  52.58 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00264968  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  44.23 
 
 
104 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
107 aa  92.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0211  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.51512e-07  unclonable  8.02476e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0207  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.41259e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4159  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.35344e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4045  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.15284e-07  unclonable  3.47385e-12 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  48.48 
 
 
103 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.84056e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0195  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 
104 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.00309e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0071  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  1.98963e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  47 
 
 
112 aa  91.3  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0224  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 
104 aa  90.9  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  8.6996e-10  unclonable  7.23515e-06 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4306  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 
104 aa  90.5  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.26624e-08  unclonable  4.82395e-11 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3748  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 
104 aa  90.5  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  8.44667e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
106 aa  90.5  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3903  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 
104 aa  90.5  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.56583e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0294  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 
104 aa  90.5  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  9.11949e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>