285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0306 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
137 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  99.27 
 
 
137 aa  279  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  92.7 
 
 
137 aa  264  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  80.92 
 
 
142 aa  229  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  77.1 
 
 
139 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  78.29 
 
 
150 aa  208  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0421  4'-phosphopantetheinyl transferase  75.57 
 
 
139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364619  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1734  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.79 
 
 
133 aa  174  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1409  4'-phosphopantetheinyl transferase  63.85 
 
 
133 aa  173  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3872  4'-phosphopantetheinyl transferase  62.88 
 
 
133 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798491  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2230  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.94 
 
 
136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558509  normal  0.0780683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0910  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.62 
 
 
135 aa  170  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.123899  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.9 
 
 
139 aa  170  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1149  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.14 
 
 
134 aa  168  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.14 
 
 
134 aa  167  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  57.25 
 
 
142 aa  166  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.31 
 
 
136 aa  166  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.54 
 
 
136 aa  165  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0948  holo-acyl-carrier-protein synthase  59.69 
 
 
133 aa  164  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2443  holo-acyl-carrier-protein synthase  59.69 
 
 
140 aa  163  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1920  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.65 
 
 
139 aa  163  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0652  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.02 
 
 
134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.512753  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0659  4'-phosphopantetheinyl transferase  58.02 
 
 
134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0916337  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0993  holo-acyl-carrier-protein synthase  58.14 
 
 
145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0239531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4685  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.15 
 
 
139 aa  161  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.1072  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2629  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.49 
 
 
158 aa  160  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597065  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2872  holo-acyl-carrier-protein synthase  63.03 
 
 
133 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2970  4'-phosphopantetheinyl transferase  59.57 
 
 
146 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7365  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.07 
 
 
132 aa  157  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.012479  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  55.3 
 
 
135 aa  156  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0532  holo-acyl-carrier-protein synthase  60.31 
 
 
134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0694245  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3457  4'-phosphopantetheinyl transferase  61.83 
 
 
136 aa  153  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412901  normal  0.605589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2610  4'-phosphopantetheinyl transferase  57.66 
 
 
141 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0757866  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6616  4'-phosphopantetheinyl transferase  65.12 
 
 
135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.495084  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0471  4'-phosphopantetheinyl transferase  50 
 
 
133 aa  150  4e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2649  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.52 
 
 
139 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.045044  normal  0.0107297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2638  4'-phosphopantetheinyl transferase  60.9 
 
 
139 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2253  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.39 
 
 
139 aa  134  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154355  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0375  4'-phosphopantetheinyl transferase  56.06 
 
 
136 aa  130  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457034  normal  0.658443 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.36 
 
 
126 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  43.41 
 
 
126 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.03 
 
 
141 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
126 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.6 
 
 
127 aa  98.6  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
126 aa  95.5  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 
129 aa  94.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.09 
 
 
126 aa  93.6  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.12 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.71 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1208  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
126 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0594  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.01 
 
 
132 aa  90.5  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0105656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.41 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1406  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.6 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  37.4 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0654  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.34 
 
 
132 aa  89  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0204419  normal  0.227641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.08 
 
 
125 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  42.97 
 
 
125 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.31 
 
 
130 aa  87.8  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.72 
 
 
126 aa  87  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.31 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0997  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.14 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947514  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3708  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  38.28 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.52 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1753  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.68 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0932  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.43 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0531027  normal  0.041098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.46 
 
 
126 aa  84  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.46 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.46 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2820  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
126 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2955  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
126 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.620212  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2615  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.35 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.69 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2780  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2843  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
126 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.819519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2739  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.62 
 
 
126 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.180999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.15 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.84 
 
 
543 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3262  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.35 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.033674 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.28 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.69 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  46.74 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3057  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.81 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.46 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.46 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  36.72 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  40.46 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.46 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.2 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.46 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.4 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3631  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.77 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.85 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.31 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.01 
 
 
126 aa  80.1  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.59 
 
 
123 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>