19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0297 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0297  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1664  hypothetical protein  99.33 
 
 
150 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2581  hypothetical protein  86.67 
 
 
150 aa  235  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453337 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0184  hypothetical protein  64.19 
 
 
150 aa  184  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.22231  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2571  hypothetical protein  62.33 
 
 
152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00137712  unclonable  0.0000000326154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0504  hypothetical protein  52.05 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  37.84 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  36.36 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4488  hypothetical protein  36.3 
 
 
151 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4355  hypothetical protein  36.3 
 
 
151 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01760  hypothetical protein  29.41 
 
 
469 aa  52.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.610994  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  34.87 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  35.62 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0151  hypothetical protein  31.61 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  32.3 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0150  hypothetical protein  31.93 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323748  normal  0.0553337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3352  hypothetical protein  33.81 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05580  hypothetical protein  31.52 
 
 
309 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0532  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.790547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>